42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2571 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2529  recombinase  99.71 
 
 		 501 aa  703    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2571  recombinase  100 
 
 		 417 aa  841    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2551  recombinase  59.37 
 
 		 412 aa  421  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4124  recombinase  35.73 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4086  hypothetical protein  34.02 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6293  recombinase  25.83 
 
 		 385 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  27.39 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  27.39 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  25.19 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  25.19 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  25.19 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  26.2 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  28.53 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  26.2 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  27.37 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  31.14 
 
 		 488 aa  76.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  26.2 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  27.62 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  22.97 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  24.93 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.11 
 
 		 529 aa  70.1  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  25.8 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  32.43 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  25.36 
 
 		 500 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  25.5 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  26.61 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  30.74 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4207  Recombinase  26.45 
 
 		 506 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.67 
 
 		 458 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.13 
 
 		 458 aa  52.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  21.15 
 
 		 462 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1907  Recombinase  28.3 
 
 		 452 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  23.16 
 
 		 503 aa  50.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  20.06 
 
 		 521 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 		 517 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20150  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.76 
 
 		 569 aa  47  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.339427  normal  0.32342 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  22.84 
 
 		 524 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  21.79 
 
 		 535 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  23.22 
 
 		 564 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  22.59 
 
 		 563 aa  44.7  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.74 
 
 		 539 aa  44.3  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  23.08 
 
 		 497 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.157742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>