38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4164 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2108  hypothetical protein  89.03 
 
 		 401 aa  730    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0876721  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4164  hypothetical protein  100 
 
 		 501 aa  1013    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2109  hypothetical protein  82.22 
 
 		 90 aa  162  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.058933  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  25.42 
 
 		 465 aa  80.1  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  25.6 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  29.47 
 
 		 494 aa  70.1  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4207  Recombinase  24.45 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  22.91 
 
 		 522 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  26.29 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  23.11 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  23.5 
 
 		 534 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  24.55 
 
 		 534 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  25.9 
 
 		 460 aa  55.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  22.2 
 
 		 485 aa  55.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4124  recombinase  23.72 
 
 		 432 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.03 
 
 		 458 aa  54.3  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  23.95 
 
 		 534 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  23.95 
 
 		 534 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  23.35 
 
 		 503 aa  54.3  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  23.31 
 
 		 500 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  22.93 
 
 		 494 aa  53.5  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  24.25 
 
 		 534 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  23.95 
 
 		 537 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  22.68 
 
 		 537 aa  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  23.94 
 
 		 537 aa  50.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  23.08 
 
 		 534 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6293  recombinase  24.54 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.38 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  24.18 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  25.11 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.24 
 
 		 458 aa  48.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4086  hypothetical protein  23.63 
 
 		 335 aa  47.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  23.83 
 
 		 586 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  23.75 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4918  resolvase domain-containing protein  24.53 
 
 		 689 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.79279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3420  resolvase domain-containing protein  24.53 
 
 		 689 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408833  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2591  Resolvase domain protein  24.03 
 
 		 490 aa  44.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0023015  hitchhiker  0.000000886482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  23.53 
 
 		 460 aa  43.5  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>