More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0891 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  100 
 
 		 460 aa  942    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  60.54 
 
 		 449 aa  541  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  59.09 
 
 		 459 aa  498  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  59.81 
 
 		 462 aa  495  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  59.95 
 
 		 462 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  53.85 
 
 		 445 aa  469  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  52.67 
 
 		 445 aa  468  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  56.25 
 
 		 443 aa  462  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  53.13 
 
 		 445 aa  463  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  51.41 
 
 		 447 aa  449  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  55.53 
 
 		 474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  54.67 
 
 		 441 aa  447  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  53.36 
 
 		 445 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  62.99 
 
 		 343 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  50.68 
 
 		 441 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  46.12 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  46.58 
 
 		 441 aa  411  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  55.52 
 
 		 522 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  48.39 
 
 		 528 aa  363  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  48.91 
 
 		 528 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  49.46 
 
 		 525 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  47.21 
 
 		 525 aa  355  7.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  52.5 
 
 		 568 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  48.22 
 
 		 511 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  44.72 
 
 		 527 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  45.96 
 
 		 506 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  51.4 
 
 		 545 aa  328  9e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  47.93 
 
 		 549 aa  309  8e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  48.02 
 
 		 532 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  48.84 
 
 		 550 aa  302  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  41.82 
 
 		 534 aa  290  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  41.98 
 
 		 534 aa  290  5.0000000000000004e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  42.51 
 
 		 534 aa  289  7e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  41.82 
 
 		 534 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  41.55 
 
 		 534 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  41.55 
 
 		 537 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  44.05 
 
 		 525 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  41.29 
 
 		 534 aa  286  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  42.9 
 
 		 537 aa  286  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  39.29 
 
 		 500 aa  282  8.000000000000001e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  40.75 
 
 		 489 aa  281  1e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  43.21 
 
 		 322 aa  264  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  41.36 
 
 		 412 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  41.25 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  32.34 
 
 		 544 aa  183  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  33.08 
 
 		 613 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  29.07 
 
 		 542 aa  167  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  29.07 
 
 		 542 aa  167  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  29.07 
 
 		 542 aa  166  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  31.74 
 
 		 665 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  32.08 
 
 		 462 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  27.09 
 
 		 521 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  25.81 
 
 		 534 aa  144  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.34 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  27.27 
 
 		 522 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  30.4 
 
 		 546 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  33.01 
 
 		 500 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  27.72 
 
 		 546 aa  137  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  29.07 
 
 		 509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  28.97 
 
 		 475 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  32.16 
 
 		 552 aa  133  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  32.04 
 
 		 515 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  25.3 
 
 		 554 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  27.53 
 
 		 421 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  23.5 
 
 		 515 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  29.89 
 
 		 485 aa  123  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  35.15 
 
 		 502 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  30.47 
 
 		 484 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  30.47 
 
 		 484 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  28.89 
 
 		 547 aa  116  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  28.53 
 
 		 561 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  25.7 
 
 		 558 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  26.54 
 
 		 558 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  27.34 
 
 		 551 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  24.51 
 
 		 522 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.27 
 
 		 522 aa  110  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  26.53 
 
 		 540 aa  109  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  25.91 
 
 		 565 aa  107  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  26.99 
 
 		 579 aa  106  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  28.32 
 
 		 474 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  26.08 
 
 		 590 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  26.33 
 
 		 500 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  26.92 
 
 		 553 aa  103  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2833  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  41.77 
 
 		 154 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  27.56 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  25.74 
 
 		 272 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  22.78 
 
 		 494 aa  100  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  24.1 
 
 		 506 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.25 
 
 		 539 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  23.54 
 
 		 554 aa  96.3  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  25.4 
 
 		 550 aa  95.9  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  25.4 
 
 		 555 aa  95.9  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  23.38 
 
 		 542 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  26.36 
 
 		 500 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  25.19 
 
 		 555 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  28.4 
 
 		 485 aa  95.5  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.68 
 
 		 517 aa  95.1  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  23.35 
 
 		 519 aa  94.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  25.7 
 
 		 519 aa  94  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  25.76 
 
 		 487 aa  94  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>