181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1907 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1907  Recombinase  100 
 
 		 452 aa  912    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4146  Recombinase  45.09 
 
 		 457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  30.75 
 
 		 497 aa  179  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  39.02 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  31.16 
 
 		 465 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  27.63 
 
 		 613 aa  89.7  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  28.24 
 
 		 460 aa  88.2  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  21.4 
 
 		 521 aa  87.8  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  30.66 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  30.66 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  30.66 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.02 
 
 		 529 aa  82.4  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  28.87 
 
 		 488 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  29.47 
 
 		 500 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  24.26 
 
 		 475 aa  79.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  30.17 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  30.17 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  26.93 
 
 		 665 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25.3 
 
 		 504 aa  77  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  25.75 
 
 		 511 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  23.91 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6293  recombinase  27.64 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  27.36 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  32.03 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  32.03 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.62 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  27.55 
 
 		 525 aa  73.2  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.48 
 
 		 522 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  25 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  25 
 
 		 534 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  25.29 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  28.44 
 
 		 281 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  25.08 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  26.14 
 
 		 467 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  26.53 
 
 		 525 aa  68.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  24.71 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  24.43 
 
 		 534 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  24.43 
 
 		 534 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  24.43 
 
 		 534 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  19.68 
 
 		 494 aa  66.6  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  20.12 
 
 		 542 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  20.12 
 
 		 542 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  27.21 
 
 		 525 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  27.62 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  20.12 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  24.43 
 
 		 534 aa  64.3  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  27.78 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2051  resolvase domain-containing protein  27.08 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  26.07 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  26.07 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  26.73 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  25.37 
 
 		 494 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  26.85 
 
 		 532 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  27 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  21.4 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  32.53 
 
 		 540 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  22.97 
 
 		 517 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  27.41 
 
 		 519 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.9 
 
 		 546 aa  61.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  28.01 
 
 		 541 aa  60.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  23.47 
 
 		 586 aa  60.5  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  27.88 
 
 		 540 aa  60.1  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  30.1 
 
 		 537 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  22.31 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 		 485 aa  59.7  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  21.81 
 
 		 546 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  21.26 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  21.84 
 
 		 534 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.48 
 
 		 539 aa  58.9  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  21.84 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  21.68 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  22.06 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4124  recombinase  25.37 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2551  recombinase  23.18 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  20.91 
 
 		 522 aa  57  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  32.41 
 
 		 503 aa  57  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  31.11 
 
 		 513 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  25.46 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.66 
 
 		 515 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  21.05 
 
 		 500 aa  55.8  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  21.48 
 
 		 528 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  21.48 
 
 		 528 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4097  Recombinase  25.37 
 
 		 575 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667971  normal  0.110676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  26.95 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  25.28 
 
 		 520 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  22.73 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3888  Recombinase  29.78 
 
 		 488 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  0.0312397 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  21.57 
 
 		 482 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  22.73 
 
 		 441 aa  54.7  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.83 
 
 		 458 aa  54.7  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4207  Recombinase  27.94 
 
 		 506 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  20.78 
 
 		 522 aa  54.3  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  24.3 
 
 		 539 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  21.69 
 
 		 500 aa  53.9  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  26.26 
 
 		 521 aa  53.5  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2656  hypothetical protein  27.32 
 
 		 331 aa  53.5  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000700215  hitchhiker  0.000699508 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.83 
 
 		 462 aa  53.5  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26050  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.5 
 
 		 511 aa  53.1  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  21.07 
 
 		 522 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  21.34 
 
 		 500 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>