More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1090 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1090  recombinase  100 
 
 		 465 aa  926    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  44.73 
 
 		 539 aa  352  5.9999999999999994e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  41.15 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  36.71 
 
 		 467 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  36.85 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  37.34 
 
 		 460 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  37.12 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  34.43 
 
 		 469 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  34.43 
 
 		 469 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  34.43 
 
 		 469 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  34.62 
 
 		 488 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  33.89 
 
 		 479 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  33.89 
 
 		 479 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  34.87 
 
 		 461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  34.36 
 
 		 494 aa  183  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20150  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.68 
 
 		 569 aa  172  9e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.339427  normal  0.32342 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26050  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.46 
 
 		 511 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  32.48 
 
 		 458 aa  170  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  30.07 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.98 
 
 		 458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  30.89 
 
 		 484 aa  156  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  28.6 
 
 		 497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6293  recombinase  30.21 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.11 
 
 		 529 aa  125  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.86 
 
 		 462 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  30.68 
 
 		 503 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2051  resolvase domain-containing protein  27.42 
 
 		 494 aa  114  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  27.76 
 
 		 522 aa  114  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.54 
 
 		 515 aa  113  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  30.48 
 
 		 528 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4124  recombinase  28.47 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.76 
 
 		 542 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  27.13 
 
 		 485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.76 
 
 		 542 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  30.48 
 
 		 528 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.76 
 
 		 542 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  27.8 
 
 		 527 aa  108  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2529  recombinase  27.55 
 
 		 501 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  30.12 
 
 		 568 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  28.31 
 
 		 500 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  25.41 
 
 		 447 aa  107  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  24.6 
 
 		 519 aa  103  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  25.87 
 
 		 606 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2551  recombinase  30.23 
 
 		 412 aa  103  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  24.13 
 
 		 475 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  25.87 
 
 		 606 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  25.59 
 
 		 521 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25.34 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  30.35 
 
 		 534 aa  100  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  25.34 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24.62 
 
 		 498 aa  99.8  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  27.74 
 
 		 443 aa  99.8  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  23.44 
 
 		 546 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.35 
 
 		 517 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  26.07 
 
 		 544 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  25 
 
 		 563 aa  99  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  27.88 
 
 		 441 aa  97.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  27.59 
 
 		 613 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  24.25 
 
 		 445 aa  97.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  32.1 
 
 		 412 aa  97.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  28.77 
 
 		 549 aa  97.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  30.52 
 
 		 485 aa  97.1  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  26.74 
 
 		 549 aa  97.1  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  28.05 
 
 		 561 aa  96.7  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  26.68 
 
 		 549 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  29.71 
 
 		 534 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  30.11 
 
 		 343 aa  95.9  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1907  Recombinase  31.16 
 
 		 452 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  30.03 
 
 		 534 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  26.98 
 
 		 576 aa  95.9  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  28.89 
 
 		 511 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  29.71 
 
 		 534 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25.06 
 
 		 504 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  29.71 
 
 		 534 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  29.71 
 
 		 534 aa  95.1  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  25.7 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  29.18 
 
 		 484 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  29.75 
 
 		 459 aa  94.4  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.39 
 
 		 426 aa  94  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  29.71 
 
 		 537 aa  94  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  27.04 
 
 		 565 aa  94  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4146  Recombinase  31.83 
 
 		 457 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  27.17 
 
 		 525 aa  93.6  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  30.28 
 
 		 542 aa  93.6  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  26.65 
 
 		 555 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  22.29 
 
 		 547 aa  93.6  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  26.43 
 
 		 558 aa  93.6  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  24.25 
 
 		 421 aa  93.6  8e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  24.77 
 
 		 524 aa  93.6  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  27.43 
 
 		 540 aa  93.2  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  27.9 
 
 		 460 aa  92.8  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  29.18 
 
 		 484 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  22.15 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  26.84 
 
 		 578 aa  92.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  29.97 
 
 		 542 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  23.7 
 
 		 482 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4207  Recombinase  28.05 
 
 		 506 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  28.35 
 
 		 562 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  28.12 
 
 		 525 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>