122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2551 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2551  recombinase  100 
 
 		 412 aa  837    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2529  recombinase  61.3 
 
 		 501 aa  521  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2571  recombinase  59.37 
 
 		 417 aa  421  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4124  recombinase  37.21 
 
 		 432 aa  220  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4086  hypothetical protein  35.1 
 
 		 335 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  27.52 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  27.52 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6293  recombinase  28.5 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  32.78 
 
 		 529 aa  123  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  28.92 
 
 		 460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  28.92 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  25.58 
 
 		 467 aa  110  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  27.67 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  28.01 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  26.88 
 
 		 461 aa  104  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  30.23 
 
 		 465 aa  103  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  26.24 
 
 		 467 aa  101  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  24.77 
 
 		 460 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  26.75 
 
 		 469 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  26.75 
 
 		 469 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  26.75 
 
 		 469 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.35 
 
 		 458 aa  87  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  28.71 
 
 		 494 aa  80.5  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.11 
 
 		 539 aa  80.1  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.07 
 
 		 458 aa  79.7  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  24.18 
 
 		 460 aa  79.7  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  26.96 
 
 		 497 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  27.13 
 
 		 484 aa  76.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.43 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  26.33 
 
 		 522 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  26.54 
 
 		 500 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.4 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.77 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  21.58 
 
 		 534 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  22.36 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  23.03 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  23.51 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  22.66 
 
 		 517 aa  63.2  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  23.33 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  23.72 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  22.01 
 
 		 485 aa  62.4  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  22.73 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24.59 
 
 		 540 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20150  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  22.91 
 
 		 569 aa  60.8  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.339427  normal  0.32342 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  25.59 
 
 		 563 aa  60.1  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  21.88 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  22.43 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  21.05 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1907  Recombinase  23.18 
 
 		 452 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  21.75 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  20.08 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4207  Recombinase  27.66 
 
 		 506 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  22.26 
 
 		 524 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25 
 
 		 547 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  22.69 
 
 		 526 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  21.45 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  20.66 
 
 		 542 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  20.66 
 
 		 542 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  21 
 
 		 447 aa  53.9  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  22.47 
 
 		 535 aa  53.9  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  20.27 
 
 		 542 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  22.53 
 
 		 441 aa  53.5  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.28 
 
 		 613 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  22.13 
 
 		 500 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  23.61 
 
 		 551 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  25.96 
 
 		 561 aa  52.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  22.22 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  23.75 
 
 		 544 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  22.08 
 
 		 548 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  23.05 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  21.37 
 
 		 558 aa  50.8  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  19.44 
 
 		 500 aa  50.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  22.92 
 
 		 500 aa  50.1  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2051  resolvase domain-containing protein  25.24 
 
 		 494 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  22.25 
 
 		 449 aa  50.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  23.64 
 
 		 590 aa  49.7  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  23 
 
 		 542 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  23.05 
 
 		 532 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  20.16 
 
 		 519 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  19.85 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  22.04 
 
 		 525 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  21.25 
 
 		 606 aa  49.3  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  21.25 
 
 		 606 aa  49.3  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  23 
 
 		 554 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  21.86 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  19.89 
 
 		 551 aa  48.9  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  19.64 
 
 		 506 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  21.41 
 
 		 515 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  24.07 
 
 		 665 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0567  Resolvase domain protein  25.08 
 
 		 577 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  20.06 
 
 		 603 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  19.61 
 
 		 552 aa  47.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  19.58 
 
 		 528 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  20.07 
 
 		 343 aa  47  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  23.3 
 
 		 503 aa  47  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  21.38 
 
 		 525 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  22.11 
 
 		 489 aa  45.8  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  22.1 
 
 		 543 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  20.75 
 
 		 550 aa  46.2  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  21.33 
 
 		 555 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>