More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2236 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  100 
 
 		 430 aa  885    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  78.18 
 
 		 442 aa  694    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  51.83 
 
 		 518 aa  378  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  44.16 
 
 		 522 aa  370  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  50.68 
 
 		 523 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  51.58 
 
 		 523 aa  363  3e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  51.58 
 
 		 523 aa  360  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  51 
 
 		 522 aa  359  5e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  51.84 
 
 		 535 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  50.86 
 
 		 523 aa  355  6.999999999999999e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  50.15 
 
 		 506 aa  344  2e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  44.25 
 
 		 552 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  50.61 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  47.59 
 
 		 431 aa  317  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  43.48 
 
 		 539 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  43.06 
 
 		 543 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  41.09 
 
 		 526 aa  276  7e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  44.57 
 
 		 522 aa  273  6e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 		 519 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  39.25 
 
 		 519 aa  267  2e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  40.61 
 
 		 521 aa  263  6e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  43.4 
 
 		 522 aa  262  8e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  41.26 
 
 		 606 aa  256  4e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  41.26 
 
 		 606 aa  256  4e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  39.5 
 
 		 520 aa  253  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  36.26 
 
 		 553 aa  239  8e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  38.1 
 
 		 534 aa  229  7e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  34.8 
 
 		 526 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  34.64 
 
 		 547 aa  195  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0420  resolvase domain-containing protein  45.73 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000164103  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  35.74 
 
 		 321 aa  153  7e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  32.38 
 
 		 511 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  29.18 
 
 		 558 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  27.61 
 
 		 542 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  29.23 
 
 		 475 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  27.61 
 
 		 542 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.75 
 
 		 542 aa  114  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  25.9 
 
 		 479 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  31.44 
 
 		 558 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  30.25 
 
 		 521 aa  106  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.07 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  28.38 
 
 		 506 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  28.65 
 
 		 515 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  32.13 
 
 		 496 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  28.34 
 
 		 487 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2698  hypothetical protein  38.89 
 
 		 194 aa  100  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  27.02 
 
 		 527 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  26.76 
 
 		 498 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.36 
 
 		 485 aa  97.4  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  28.66 
 
 		 488 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  29.66 
 
 		 537 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2730  Recombinase  28.57 
 
 		 326 aa  94.4  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  27.92 
 
 		 544 aa  94  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  29.73 
 
 		 281 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  30.22 
 
 		 535 aa  93.2  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  25.62 
 
 		 513 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0528  hypothetical protein  39.13 
 
 		 163 aa  92.4  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000114476 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  27.7 
 
 		 475 aa  92  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1525  Recombinase  27.94 
 
 		 299 aa  90.5  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000398733  hitchhiker  0.000531049 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  27.18 
 
 		 528 aa  90.1  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  27.18 
 
 		 528 aa  90.1  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  27.38 
 
 		 484 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  24.71 
 
 		 546 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  26.37 
 
 		 565 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  25 
 
 		 541 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  28.28 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0737  hypothetical protein  61.29 
 
 		 64 aa  88.2  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00205716 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  27.09 
 
 		 484 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  24.07 
 
 		 537 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.14 
 
 		 546 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  29.01 
 
 		 578 aa  86.7  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  30.32 
 
 		 564 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  26.44 
 
 		 738 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  26.48 
 
 		 534 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  25.93 
 
 		 534 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  27.99 
 
 		 597 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  23.88 
 
 		 613 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  23.98 
 
 		 580 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  27.56 
 
 		 549 aa  84  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  26.37 
 
 		 578 aa  84  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  27.62 
 
 		 537 aa  83.6  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  26.37 
 
 		 601 aa  83.6  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  26.69 
 
 		 522 aa  83.2  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  26.57 
 
 		 534 aa  83.2  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  26.63 
 
 		 517 aa  83.2  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24.01 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  26.57 
 
 		 534 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  26.57 
 
 		 534 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  26.92 
 
 		 534 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  26.57 
 
 		 537 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  27.08 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  26.57 
 
 		 534 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  27.47 
 
 		 586 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.89 
 
 		 522 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0003  putative site-specific recombinase  24.67 
 
 		 509 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  29.06 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  26.39 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  30.12 
 
 		 509 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  27.69 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  26.13 
 
 		 295 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>