132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1525 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1525  Recombinase  100 
 
 
299 aa  625  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000398733  hitchhiker  0.000531049 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2730  Recombinase  38.89 
 
 
326 aa  230  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  27.4 
 
 
526 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  25.51 
 
 
519 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  25.72 
 
 
519 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.35 
 
 
522 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  23.77 
 
 
521 aa  96.7  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  25.93 
 
 
522 aa  95.9  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  24.13 
 
 
520 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  25.23 
 
 
523 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  28.7 
 
 
442 aa  93.6  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  24.85 
 
 
543 aa  93.2  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  23.5 
 
 
526 aa  92.8  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  24.85 
 
 
523 aa  92.4  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  24.17 
 
 
522 aa  91.3  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  27.94 
 
 
430 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  24.33 
 
 
523 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  24.92 
 
 
523 aa  90.1  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  23.12 
 
 
506 aa  84.7  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  20.99 
 
 
553 aa  82.8  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1670  recombinase  36.8 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2439  Recombinase  25.58 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  23.56 
 
 
518 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.73 
 
 
510 aa  80.1  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1611  recombinase  34.23 
 
 
141 aa  78.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1273  recombinase  34.23 
 
 
141 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0283876  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2815  Recombinase  37.39 
 
 
137 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.066428  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  21.35 
 
 
606 aa  75.1  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0418  hypothetical protein  35.34 
 
 
149 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  21.35 
 
 
606 aa  75.1  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  26.21 
 
 
429 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3888  Recombinase  30.32 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.142462 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  23.12 
 
 
522 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  26.89 
 
 
539 aa  72.8  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  22.35 
 
 
535 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1068  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1608  recombinase  33.33 
 
 
151 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0140607  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  26.54 
 
 
421 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  23.32 
 
 
322 aa  63.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  29.23 
 
 
462 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  24.27 
 
 
431 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  23.56 
 
 
580 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  23.92 
 
 
447 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  23.67 
 
 
445 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  24.88 
 
 
552 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  27.17 
 
 
509 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  22.43 
 
 
415 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  24.74 
 
 
475 aa  57  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  24.15 
 
 
445 aa  57  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2732  recombinase  23.51 
 
 
583 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  28.36 
 
 
444 aa  57  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  26.07 
 
 
506 aa  56.6  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  20.78 
 
 
521 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  24.15 
 
 
445 aa  56.2  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  23.1 
 
 
484 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  21.3 
 
 
517 aa  56.2  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  22.43 
 
 
522 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2727  Recombinase  28.26 
 
 
590 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  23.53 
 
 
504 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  23.56 
 
 
534 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  23.19 
 
 
547 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  28.86 
 
 
484 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  26.06 
 
 
537 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  22.59 
 
 
479 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  22.59 
 
 
479 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  22.75 
 
 
563 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  25.28 
 
 
531 aa  53.1  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  24.69 
 
 
475 aa  52.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  20.92 
 
 
487 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  33.77 
 
 
513 aa  52.4  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  24.15 
 
 
529 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  23.64 
 
 
525 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  25.41 
 
 
665 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  23.79 
 
 
498 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  28.87 
 
 
534 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  23.64 
 
 
525 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  24.86 
 
 
613 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  28.17 
 
 
534 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3036  recombinase  22.26 
 
 
548 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  30.3 
 
 
462 aa  50.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  28.17 
 
 
534 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  28.17 
 
 
534 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1544  resolvase domain-containing protein  25.57 
 
 
503 aa  50.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.197317  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  28.17 
 
 
534 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  26.74 
 
 
564 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2215  DNA recombinase, putative  24.47 
 
 
192 aa  50.1  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  28.87 
 
 
537 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  35.37 
 
 
272 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2537  recombinase  23.43 
 
 
556 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3675  Recombinase  27.63 
 
 
545 aa  48.9  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  24.62 
 
 
546 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  24.26 
 
 
465 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  28.17 
 
 
534 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3143  resolvase-like:recombinase  24.24 
 
 
622 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  23.79 
 
 
414 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  29.09 
 
 
462 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3165  recombinase  24.38 
 
 
548 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.944901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3227  recombinase  24.38 
 
 
548 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.371696  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3177  recombinase  24.38 
 
 
548 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560591  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4097  Recombinase  35.64 
 
 
575 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667971  normal  0.110676 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>