34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0737 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0737  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  130  6.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00205716 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  79.03 
 
 		 523 aa  103  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  74.19 
 
 		 523 aa  100  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  74.19 
 
 		 523 aa  99.8  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  70.97 
 
 		 522 aa  97.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  70.97 
 
 		 523 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  69.35 
 
 		 518 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  66.67 
 
 		 535 aa  95.5  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  69.35 
 
 		 522 aa  95.9  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  69.35 
 
 		 506 aa  94  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  61.29 
 
 		 430 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  62.9 
 
 		 442 aa  86.7  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  57.14 
 
 		 552 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  56.67 
 
 		 539 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0420  resolvase domain-containing protein  58.62 
 
 		 342 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000164103  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  52.38 
 
 		 431 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  53.33 
 
 		 526 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  59.32 
 
 		 519 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  59.32 
 
 		 520 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  59.32 
 
 		 521 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  56.14 
 
 		 519 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  55.17 
 
 		 606 aa  70.1  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  55.17 
 
 		 606 aa  70.1  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  47.54 
 
 		 543 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  56.14 
 
 		 526 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  52.54 
 
 		 522 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  52.54 
 
 		 522 aa  67  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  59.02 
 
 		 429 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  49.18 
 
 		 534 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  46.67 
 
 		 553 aa  61.2  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  46.67 
 
 		 547 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  43.1 
 
 		 321 aa  57.4  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0528  hypothetical protein  41.38 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000114476 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  34.92 
 
 		 511 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>