57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2698 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2698  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  404  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  47.4 
 
 		 539 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  44.24 
 
 		 535 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  41.72 
 
 		 431 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  40.86 
 
 		 552 aa  134  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  42.41 
 
 		 523 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  42.41 
 
 		 523 aa  128  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  43.42 
 
 		 523 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  42.76 
 
 		 523 aa  119  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  38.12 
 
 		 522 aa  115  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  40.52 
 
 		 518 aa  112  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  38.78 
 
 		 522 aa  108  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  38.46 
 
 		 429 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  39.58 
 
 		 442 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  38.31 
 
 		 506 aa  102  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  34.3 
 
 		 606 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  38.89 
 
 		 430 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  34.3 
 
 		 606 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  37.88 
 
 		 519 aa  95.5  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 522 aa  92  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  33.09 
 
 		 526 aa  89.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  37.78 
 
 		 522 aa  90.1  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  36.51 
 
 		 520 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  37.01 
 
 		 521 aa  86.7  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  33.59 
 
 		 553 aa  86.7  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  35.16 
 
 		 534 aa  84.7  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 		 519 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3888  Recombinase  34.38 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.142462 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  32.98 
 
 		 498 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  30 
 
 		 543 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  30.07 
 
 		 511 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  31.03 
 
 		 526 aa  68.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  35.4 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  30.06 
 
 		 547 aa  57.4  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  28.35 
 
 		 580 aa  55.1  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  30.51 
 
 		 504 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1010  resolvase-like protein  29.41 
 
 		 322 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.204913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  29.36 
 
 		 535 aa  52.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2730  Recombinase  24.05 
 
 		 326 aa  52  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  29.93 
 
 		 532 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  30.85 
 
 		 321 aa  50.1  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  27.59 
 
 		 504 aa  49.7  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  25 
 
 		 475 aa  48.5  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  25.79 
 
 		 537 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  27.94 
 
 		 548 aa  47.8  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  28.76 
 
 		 551 aa  46.6  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  29.84 
 
 		 515 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  25.76 
 
 		 541 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  26.02 
 
 		 506 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3480  recombinase  26.06 
 
 		 532 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000373145  decreased coverage  0.0098808 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1525  Recombinase  23.91 
 
 		 299 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000398733  hitchhiker  0.000531049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  26.98 
 
 		 656 aa  41.6  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  23.67 
 
 		 563 aa  41.2  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25 
 
 		 484 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25 
 
 		 484 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3888  Recombinase  24.76 
 
 		 488 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  0.0312397 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0728  hypothetical protein  43.18 
 
 		 66 aa  41.2  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00271301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>