260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3842 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  100 
 
 		 626 aa  1275    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  31.7 
 
 		 707 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  31.3 
 
 		 541 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  29.09 
 
 		 542 aa  200  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  29.04 
 
 		 540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  32.54 
 
 		 558 aa  195  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  29.2 
 
 		 542 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  28.9 
 
 		 738 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  31.75 
 
 		 564 aa  180  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  31.67 
 
 		 549 aa  178  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0980  Resolvase domain  29.17 
 
 		 707 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0578275 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  32.6 
 
 		 565 aa  169  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  29.08 
 
 		 662 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  30.52 
 
 		 537 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  27.04 
 
 		 551 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  29.51 
 
 		 562 aa  167  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  30.42 
 
 		 578 aa  166  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  30.42 
 
 		 601 aa  166  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  29.12 
 
 		 578 aa  164  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  29.14 
 
 		 552 aa  164  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  29.93 
 
 		 597 aa  164  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  29.94 
 
 		 576 aa  163  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  28.96 
 
 		 569 aa  160  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  30.25 
 
 		 549 aa  159  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  29.31 
 
 		 539 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  27.79 
 
 		 584 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  28.52 
 
 		 558 aa  157  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  31.5 
 
 		 546 aa  156  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  28.86 
 
 		 564 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  32.41 
 
 		 336 aa  128  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  27.57 
 
 		 532 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0979  Resolvase domain  24.76 
 
 		 678 aa  117  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.127172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  35.8 
 
 		 251 aa  117  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  25.15 
 
 		 862 aa  110  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  27.9 
 
 		 520 aa  110  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  31.6 
 
 		 279 aa  108  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  33.99 
 
 		 277 aa  107  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  28.62 
 
 		 504 aa  107  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  26.42 
 
 		 511 aa  105  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  23.76 
 
 		 475 aa  97.1  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  26 
 
 		 498 aa  97.1  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  27.41 
 
 		 553 aa  95.5  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  25.69 
 
 		 534 aa  94.7  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  30.37 
 
 		 540 aa  92.8  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  21.78 
 
 		 487 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  22.08 
 
 		 488 aa  90.5  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  26 
 
 		 485 aa  90.1  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  27.35 
 
 		 542 aa  89.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  27.35 
 
 		 542 aa  89.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  26.07 
 
 		 535 aa  89.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  27.12 
 
 		 542 aa  88.2  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  25.56 
 
 		 522 aa  88.2  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  23.8 
 
 		 479 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.72 
 
 		 522 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  23.99 
 
 		 515 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.32 
 
 		 494 aa  85.5  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  27.3 
 
 		 484 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  25.49 
 
 		 506 aa  83.6  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  27.03 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  26.03 
 
 		 485 aa  81.6  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  23.6 
 
 		 580 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  28.23 
 
 		 511 aa  77  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  23.4 
 
 		 521 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  28.92 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.71 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  27.94 
 
 		 252 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  23.4 
 
 		 519 aa  75.1  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  25.32 
 
 		 524 aa  75.5  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  25.86 
 
 		 535 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  28.97 
 
 		 513 aa  75.1  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  22.79 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.61 
 
 		 462 aa  73.9  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  25.15 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  21.68 
 
 		 534 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  24.18 
 
 		 518 aa  72.8  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  23.14 
 
 		 521 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  26.35 
 
 		 505 aa  72.4  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  22.84 
 
 		 500 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4799  recombinase  39.56 
 
 		 564 aa  72  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284934  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  27.48 
 
 		 547 aa  72  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  23.2 
 
 		 546 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  29.8 
 
 		 465 aa  72.4  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  29.69 
 
 		 283 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  31.47 
 
 		 515 aa  71.2  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  23.95 
 
 		 586 aa  70.5  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  27.71 
 
 		 552 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  22.5 
 
 		 520 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  25.72 
 
 		 525 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  26.42 
 
 		 445 aa  70.1  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  25.33 
 
 		 415 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  26.1 
 
 		 519 aa  68.9  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  25.19 
 
 		 496 aa  68.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  23.58 
 
 		 523 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  29.92 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  27.31 
 
 		 526 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  23.28 
 
 		 523 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  25.74 
 
 		 430 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  22.06 
 
 		 523 aa  65.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  22.06 
 
 		 523 aa  65.9  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25.84 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>