148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3757 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3757  Resolvase domain protein  100 
 
 
341 aa  683    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3618  resolvase-like protein  99.47 
 
 
190 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.95899  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  32.94 
 
 
281 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  33.19 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  32.65 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  26.03 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.12 
 
 
462 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  32.98 
 
 
513 aa  69.3  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  27.78 
 
 
515 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  29.84 
 
 
707 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  27.61 
 
 
613 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  29.03 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  25.43 
 
 
429 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  29.73 
 
 
465 aa  63.5  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  28.75 
 
 
510 aa  62.8  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0143  recombinase  27.08 
 
 
565 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.88 
 
 
515 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  29.96 
 
 
460 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 
542 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 
542 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  24.71 
 
 
520 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  26.2 
 
 
517 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.15 
 
 
542 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2774  hypothetical protein  24.55 
 
 
644 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  27.6 
 
 
515 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  23.73 
 
 
498 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  25.85 
 
 
546 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  23.28 
 
 
519 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  23.15 
 
 
521 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  33.53 
 
 
626 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  24.38 
 
 
475 aa  57.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  29.17 
 
 
549 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  28.71 
 
 
665 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  27.81 
 
 
488 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3310  recombinase family  22.58 
 
 
501 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19852  hitchhiker  0.000000416205 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.89 
 
 
522 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  27.99 
 
 
509 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  31.92 
 
 
251 aa  54.7  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  26.24 
 
 
551 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25 
 
 
504 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  24.89 
 
 
522 aa  54.3  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  25.95 
 
 
431 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  26.64 
 
 
500 aa  53.9  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  23.46 
 
 
526 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  26.67 
 
 
489 aa  53.5  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.76 
 
 
522 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0567  Resolvase domain protein  30.14 
 
 
577 aa  52.8  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  22.73 
 
 
519 aa  52.8  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  27.05 
 
 
516 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2727  Recombinase  25.52 
 
 
590 aa  52.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  27.05 
 
 
516 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  28.8 
 
 
525 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  29.06 
 
 
550 aa  52.8  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  29.97 
 
 
534 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  29.68 
 
 
552 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  28.57 
 
 
503 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  28.4 
 
 
525 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1501  hypothetical protein  24.86 
 
 
512 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.420622  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.9 
 
 
426 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2909  recombinase  26.72 
 
 
465 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  21.38 
 
 
494 aa  51.6  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  30.88 
 
 
551 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  30.88 
 
 
662 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3468  recombinase  23.36 
 
 
571 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723341  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  30.5 
 
 
597 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  26.2 
 
 
546 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  23.33 
 
 
415 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  24.21 
 
 
540 aa  50.8  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3240  Recombinase  34.45 
 
 
582 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.143535  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0979  Resolvase domain  26.74 
 
 
678 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.127172 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  25.18 
 
 
506 aa  50.4  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  26.33 
 
 
578 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  28.29 
 
 
511 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 
380 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  26.03 
 
 
485 aa  50.4  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  26.33 
 
 
601 aa  50.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  30.05 
 
 
558 aa  49.7  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  24.63 
 
 
522 aa  50.1  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  27.78 
 
 
221 aa  50.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  28.66 
 
 
562 aa  50.1  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  28.51 
 
 
641 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  23.77 
 
 
496 aa  49.7  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  26.48 
 
 
862 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  22.93 
 
 
539 aa  49.3  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  38.37 
 
 
564 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  26.72 
 
 
518 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  28.99 
 
 
469 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  28.99 
 
 
469 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  28.99 
 
 
469 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  29.34 
 
 
534 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  27.06 
 
 
528 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  31.6 
 
 
537 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  26.67 
 
 
528 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  31.44 
 
 
564 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  29.34 
 
 
534 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  29.34 
 
 
534 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  25.32 
 
 
580 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  30.9 
 
 
549 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  28.75 
 
 
494 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  25 
 
 
523 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>