13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3586 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3586  Resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 401 aa  823    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  35.73 
 
 		 656 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  35.33 
 
 		 598 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  34.07 
 
 		 546 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  34.65 
 
 		 485 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3094  recombinase  28.63 
 
 		 386 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  23.67 
 
 		 548 aa  46.6  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02510  Recombinase  22.13 
 
 		 518 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  21.93 
 
 		 552 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2906  resolvase family site-specific recombinase  22.13 
 
 		 518 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02474  hypothetical protein  22.13 
 
 		 518 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  26.39 
 
 		 569 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  24.24 
 
 		 738 aa  42.7  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>