120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1368 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1368  recombinase  100 
 
 
453 aa  904    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.118986  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  27.16 
 
 
513 aa  81.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  30.3 
 
 
515 aa  77  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  30.14 
 
 
516 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  29.68 
 
 
516 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  24.91 
 
 
515 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  23.11 
 
 
540 aa  67.8  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  22.44 
 
 
517 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25.83 
 
 
504 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  25.16 
 
 
493 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24.48 
 
 
498 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  28.52 
 
 
465 aa  65.1  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.01 
 
 
458 aa  64.7  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  25.48 
 
 
665 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  22.04 
 
 
558 aa  64.3  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  23.23 
 
 
568 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  24.48 
 
 
613 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  23.13 
 
 
525 aa  63.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  22.22 
 
 
539 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  24.18 
 
 
510 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25.71 
 
 
484 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.71 
 
 
484 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  24.61 
 
 
563 aa  60.1  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  28.47 
 
 
479 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  28.47 
 
 
479 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.75 
 
 
546 aa  59.7  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  26.22 
 
 
485 aa  59.3  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  23.36 
 
 
475 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  22.37 
 
 
487 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  26.08 
 
 
497 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  22.76 
 
 
479 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  22.42 
 
 
488 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.53 
 
 
547 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  23.32 
 
 
641 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  28.98 
 
 
281 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  25.71 
 
 
541 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  23.42 
 
 
429 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  30.77 
 
 
295 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  21.33 
 
 
534 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  29.49 
 
 
738 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  24.39 
 
 
529 aa  55.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  23.37 
 
 
519 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  19.74 
 
 
505 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  25.52 
 
 
524 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  25.35 
 
 
252 aa  53.9  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  21.22 
 
 
462 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  24.73 
 
 
561 aa  53.1  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  21.76 
 
 
482 aa  53.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  27.87 
 
 
488 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  23.58 
 
 
546 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  25.32 
 
 
534 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2975  resolvase domain-containing protein  22.79 
 
 
516 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  25.65 
 
 
534 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  23.34 
 
 
527 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  23.84 
 
 
532 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  25.65 
 
 
534 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  25.16 
 
 
534 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  25.65 
 
 
534 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0231  resolvase domain-containing protein  24.79 
 
 
519 aa  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.829739  normal  0.106092 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  22.77 
 
 
517 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  26.2 
 
 
485 aa  51.6  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  24.61 
 
 
537 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  31.29 
 
 
441 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  23.62 
 
 
626 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  27.87 
 
 
484 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  23.35 
 
 
445 aa  51.2  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  26.04 
 
 
474 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0737  resolvase  26.6 
 
 
542 aa  50.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0547783  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  24.86 
 
 
576 aa  50.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  20.82 
 
 
535 aa  50.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  22.73 
 
 
522 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  24.84 
 
 
537 aa  50.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  21.45 
 
 
496 aa  50.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  24.16 
 
 
586 aa  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  23.23 
 
 
415 aa  50.1  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  25.65 
 
 
534 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  23.53 
 
 
528 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  23.53 
 
 
528 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  22.78 
 
 
500 aa  49.3  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  25.51 
 
 
546 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  20.7 
 
 
449 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  20.7 
 
 
449 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  24.76 
 
 
549 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0248  resolvase domain-containing protein  24.86 
 
 
524 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000541084  hitchhiker  0.00459613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3468  recombinase  28.37 
 
 
571 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723341  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7609  resolvase domain-containing protein  26.4 
 
 
690 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.918322 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  23.86 
 
 
539 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  23.06 
 
 
445 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  28.33 
 
 
283 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1691  resolvase domain-containing protein  24.6 
 
 
491 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0333311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6777  resolvase domain-containing protein  29.35 
 
 
656 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1010  resolvase-like protein  27.56 
 
 
322 aa  47.4  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.204913  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  22.19 
 
 
558 aa  47  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  22.15 
 
 
606 aa  47  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  22.15 
 
 
606 aa  47  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  27.94 
 
 
198 aa  46.6  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2909  recombinase  24.82 
 
 
465 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  24.44 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1544  resolvase domain-containing protein  22.83 
 
 
503 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.197317  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2730  Recombinase  25.69 
 
 
326 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>