82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3227 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00494  predicted recombinase  100 
 
 
508 aa  1046    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3227  recombinase family protein  100 
 
 
508 aa  1046    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171762  hitchhiker  0.00185611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2727  Recombinase  34.56 
 
 
590 aa  202  8e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2774  hypothetical protein  32.59 
 
 
644 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3675  Recombinase  34.4 
 
 
545 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1409  putative recombinase  30.54 
 
 
506 aa  182  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0143  recombinase  30.41 
 
 
565 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3143  resolvase-like:recombinase  32.79 
 
 
622 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0107  recombinase  32.69 
 
 
544 aa  179  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0003  putative site-specific recombinase  32.02 
 
 
509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1118  recombinase-related protein  29.88 
 
 
563 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236338  unclonable  0.000000608507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1905  recombinase  29.71 
 
 
585 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302964  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3310  recombinase  28.66 
 
 
589 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3468  recombinase  32.55 
 
 
571 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723341  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3480  recombinase  29.48 
 
 
532 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000373145  decreased coverage  0.0098808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1544  resolvase domain-containing protein  28.76 
 
 
503 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.197317  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3889  recombinase  27.43 
 
 
560 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0513638  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0128  Resolvase domain  30.43 
 
 
526 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000180819  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3026  phage recombinase, putative  25.67 
 
 
541 aa  133  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0613972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4018  hypothetical protein  31.03 
 
 
539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22270  recombinase  30.67 
 
 
525 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000532619  unclonable  9.12817e-22 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1644  recombinase  26.49 
 
 
550 aa  128  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2440  recombinase  28.17 
 
 
540 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2317  hypothetical protein  31.4 
 
 
534 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306066  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0490  putative site-specific recombinase  28.67 
 
 
681 aa  118  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2612  recombinase  27.91 
 
 
601 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0835  resolvase domain-containing protein  25.99 
 
 
548 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.05 
 
 
494 aa  77  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  25.75 
 
 
496 aa  75.1  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  23.76 
 
 
515 aa  70.1  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.2 
 
 
506 aa  65.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  25.35 
 
 
548 aa  63.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  23.48 
 
 
523 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  22.93 
 
 
523 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  24.65 
 
 
613 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  25.9 
 
 
516 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.26 
 
 
522 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  25 
 
 
603 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  25.9 
 
 
516 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  24.47 
 
 
523 aa  59.7  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  23.42 
 
 
500 aa  58.9  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  24.32 
 
 
523 aa  59.3  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  24.57 
 
 
542 aa  58.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  24.71 
 
 
554 aa  58.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  25.2 
 
 
550 aa  58.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  25.2 
 
 
555 aa  57.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0768  hypothetical protein  25.66 
 
 
552 aa  58.2  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.914496  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  22.19 
 
 
415 aa  57  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  23.67 
 
 
515 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  25.86 
 
 
544 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25.34 
 
 
504 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  26.01 
 
 
552 aa  53.9  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  21.08 
 
 
517 aa  53.5  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  22.79 
 
 
518 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  23.18 
 
 
444 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  24 
 
 
537 aa  50.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.48 
 
 
510 aa  50.1  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  21.88 
 
 
520 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  22.74 
 
 
526 aa  48.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  21.65 
 
 
528 aa  47.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  21.66 
 
 
590 aa  47.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  21.65 
 
 
528 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  22.1 
 
 
558 aa  47.4  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  23.1 
 
 
442 aa  47.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1233  Recombinase  28.29 
 
 
469 aa  47  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  24.4 
 
 
429 aa  47  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  22.83 
 
 
534 aa  47  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  21.81 
 
 
551 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  24.1 
 
 
281 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  23.39 
 
 
543 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  23.56 
 
 
421 aa  45.1  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  24.29 
 
 
515 aa  45.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  21.98 
 
 
554 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24.53 
 
 
540 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  22.57 
 
 
535 aa  44.3  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  23.2 
 
 
460 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  24.93 
 
 
534 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1691  resolvase domain-containing protein  21.43 
 
 
491 aa  43.5  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0333311  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3757  Resolvase domain protein  24.68 
 
 
341 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  23.08 
 
 
414 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  23.28 
 
 
521 aa  43.5  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  23.12 
 
 
561 aa  43.1  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>