32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2440 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2440  recombinase  100 
 
 		 540 aa  1100    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1644  recombinase  60.75 
 
 		 550 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4018  hypothetical protein  54.84 
 
 		 539 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3026  phage recombinase, putative  55.83 
 
 		 541 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0613972 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3889  recombinase  53.45 
 
 		 560 aa  552  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0513638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0128  Resolvase domain  51.36 
 
 		 526 aa  528  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000180819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0143  recombinase  36.92 
 
 		 565 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3143  resolvase-like:recombinase  31.12 
 
 		 622 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1905  recombinase  30.65 
 
 		 585 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2727  Recombinase  29.32 
 
 		 590 aa  165  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2774  hypothetical protein  29.8 
 
 		 644 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0003  putative site-specific recombinase  30.28 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3675  Recombinase  32.02 
 
 		 545 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0107  recombinase  26.78 
 
 		 544 aa  140  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1118  recombinase-related protein  28.15 
 
 		 563 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236338  unclonable  0.000000608507 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3227  recombinase family protein  28.17 
 
 		 508 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171762  hitchhiker  0.00185611 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00494  predicted recombinase  28.17 
 
 		 508 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148642  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22270  recombinase  29.1 
 
 		 525 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000532619  unclonable  9.12817e-22 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3310  recombinase  29.49 
 
 		 589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3480  recombinase  30.28 
 
 		 532 aa  110  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000373145  decreased coverage  0.0098808 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3468  recombinase  26.55 
 
 		 571 aa  107  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1409  putative recombinase  25.26 
 
 		 506 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1544  resolvase domain-containing protein  26.73 
 
 		 503 aa  96.3  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.197317  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2317  hypothetical protein  26.11 
 
 		 534 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306066  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2612  recombinase  25.88 
 
 		 601 aa  87.8  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0490  putative site-specific recombinase  32.28 
 
 		 681 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402032  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0768  hypothetical protein  27.08 
 
 		 552 aa  61.6  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.914496  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0835  resolvase domain-containing protein  22.27 
 
 		 548 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3150  Resolvase domain protein  21.34 
 
 		 532 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  29.89 
 
 		 665 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  21.87 
 
 		 447 aa  47.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  21.24 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>