76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_22270 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_22270  recombinase  100 
 
 		 525 aa  1082    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000532619  unclonable  9.12817e-22 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2317  hypothetical protein  45.34 
 
 		 534 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306066  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3480  recombinase  39.48 
 
 		 532 aa  333  5e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000373145  decreased coverage  0.0098808 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2612  recombinase  30.41 
 
 		 601 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2774  hypothetical protein  27.84 
 
 		 644 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3675  Recombinase  29.69 
 
 		 545 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1409  putative recombinase  27.91 
 
 		 506 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1905  recombinase  24.75 
 
 		 585 aa  130  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302964  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00494  predicted recombinase  30.67 
 
 		 508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3227  recombinase family protein  30.67 
 
 		 508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171762  hitchhiker  0.00185611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0143  recombinase  25.37 
 
 		 565 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3143  resolvase-like:recombinase  27.29 
 
 		 622 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0128  Resolvase domain  27.4 
 
 		 526 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000180819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2727  Recombinase  25.78 
 
 		 590 aa  127  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1118  recombinase-related protein  27.45 
 
 		 563 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236338  unclonable  0.000000608507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1644  recombinase  27.86 
 
 		 550 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0003  putative site-specific recombinase  26.49 
 
 		 509 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3889  recombinase  27.32 
 
 		 560 aa  118  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0513638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2440  recombinase  29.1 
 
 		 540 aa  118  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4018  hypothetical protein  28.01 
 
 		 539 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3310  recombinase  25.22 
 
 		 589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0107  recombinase  26.5 
 
 		 544 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1544  resolvase domain-containing protein  28.36 
 
 		 503 aa  99.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.197317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3026  phage recombinase, putative  25.62 
 
 		 541 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0613972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3468  recombinase  27.38 
 
 		 571 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0490  putative site-specific recombinase  29.89 
 
 		 681 aa  74.3  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  22.01 
 
 		 498 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0835  resolvase domain-containing protein  23.53 
 
 		 548 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  23.7 
 
 		 485 aa  66.6  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.01 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  23.93 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  24.75 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  23.66 
 
 		 537 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  24.94 
 
 		 565 aa  56.2  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  26.28 
 
 		 528 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  20.87 
 
 		 506 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  25.91 
 
 		 528 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  22.22 
 
 		 442 aa  54.7  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  21.72 
 
 		 488 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  21.91 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  27.54 
 
 		 546 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  23.92 
 
 		 540 aa  52.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  23.89 
 
 		 541 aa  51.6  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  23.91 
 
 		 597 aa  51.6  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  21.1 
 
 		 539 aa  50.8  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  23.79 
 
 		 484 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  21.96 
 
 		 553 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  23.36 
 
 		 601 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  23.36 
 
 		 578 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  25.54 
 
 		 563 aa  49.3  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  22.03 
 
 		 515 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  24.49 
 
 		 548 aa  49.3  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  23.35 
 
 		 484 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  24.53 
 
 		 441 aa  47.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  24.77 
 
 		 576 aa  47.4  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1010  resolvase-like protein  26.69 
 
 		 322 aa  47  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.204913  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  27 
 
 		 460 aa  47  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  23.58 
 
 		 549 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  21.32 
 
 		 449 aa  46.6  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1525  Recombinase  29.17 
 
 		 299 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000398733  hitchhiker  0.000531049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  29.54 
 
 		 545 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  24.33 
 
 		 569 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  25 
 
 		 562 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  20.86 
 
 		 539 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  24.05 
 
 		 578 aa  46.2  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  24.26 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  22.4 
 
 		 497 aa  45.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  24.05 
 
 		 558 aa  45.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  19.95 
 
 		 522 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  28.83 
 
 		 496 aa  45.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  24.84 
 
 		 515 aa  44.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  23.48 
 
 		 584 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  23.61 
 
 		 549 aa  43.9  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  17.42 
 
 		 494 aa  43.5  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  23.96 
 
 		 544 aa  43.5  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  24.58 
 
 		 510 aa  43.5  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>