66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3310 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3310  recombinase  100 
 
 		 589 aa  1224    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1118  recombinase-related protein  37.82 
 
 		 563 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236338  unclonable  0.000000608507 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0143  recombinase  35.33 
 
 		 565 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2774  hypothetical protein  35.83 
 
 		 644 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2727  Recombinase  34.5 
 
 		 590 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1905  recombinase  35.27 
 
 		 585 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3143  resolvase-like:recombinase  31.97 
 
 		 622 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0107  recombinase  33.73 
 
 		 544 aa  192  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0003  putative site-specific recombinase  33.95 
 
 		 509 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3675  Recombinase  29.98 
 
 		 545 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00494  predicted recombinase  28.66 
 
 		 508 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3227  recombinase family protein  28.66 
 
 		 508 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171762  hitchhiker  0.00185611 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0490  putative site-specific recombinase  31.19 
 
 		 681 aa  156  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402032  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3889  recombinase  30.4 
 
 		 560 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0513638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3468  recombinase  32.85 
 
 		 571 aa  151  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0128  Resolvase domain  27.84 
 
 		 526 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000180819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1644  recombinase  31.74 
 
 		 550 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3026  phage recombinase, putative  29.3 
 
 		 541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0613972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1544  resolvase domain-containing protein  29.44 
 
 		 503 aa  118  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.197317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1409  putative recombinase  24.43 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2440  recombinase  29.49 
 
 		 540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22270  recombinase  25.22 
 
 		 525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000532619  unclonable  9.12817e-22 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3480  recombinase  26.07 
 
 		 532 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000373145  decreased coverage  0.0098808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4018  hypothetical protein  27.27 
 
 		 539 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2317  hypothetical protein  26.96 
 
 		 534 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306066  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2612  recombinase  26.75 
 
 		 601 aa  94  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0835  resolvase domain-containing protein  23.77 
 
 		 548 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  24.68 
 
 		 578 aa  65.1  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0768  hypothetical protein  23.75 
 
 		 552 aa  62.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.914496  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.09 
 
 		 542 aa  62  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  24.6 
 
 		 539 aa  61.6  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  24.02 
 
 		 569 aa  61.2  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.88 
 
 		 542 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.88 
 
 		 542 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  24.5 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  22.57 
 
 		 496 aa  57.8  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20150  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  23.17 
 
 		 569 aa  56.6  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.339427  normal  0.32342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  22.78 
 
 		 537 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  26.29 
 
 		 527 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  26.48 
 
 		 528 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  22.26 
 
 		 506 aa  55.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  26.48 
 
 		 528 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  23.54 
 
 		 551 aa  54.7  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  23.66 
 
 		 540 aa  54.3  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  24.6 
 
 		 504 aa  53.9  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  24.57 
 
 		 546 aa  52  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  21.86 
 
 		 554 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  21.86 
 
 		 542 aa  49.3  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  23.26 
 
 		 549 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  22.14 
 
 		 517 aa  49.3  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  22.86 
 
 		 584 aa  49.7  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  24.76 
 
 		 547 aa  48.9  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  26.98 
 
 		 429 aa  48.5  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  23.13 
 
 		 431 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  26.36 
 
 		 738 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  24.53 
 
 		 561 aa  47  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  22.1 
 
 		 537 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  24.16 
 
 		 421 aa  45.8  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  27.85 
 
 		 504 aa  46.2  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  26.77 
 
 		 465 aa  46.2  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  22.57 
 
 		 485 aa  44.7  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  21.4 
 
 		 524 aa  44.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  26.06 
 
 		 488 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  22.93 
 
 		 562 aa  44.3  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  23.14 
 
 		 555 aa  43.9  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  23.96 
 
 		 626 aa  43.9  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>