27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0768 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0768  hypothetical protein  100 
 
 		 552 aa  1132    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.914496  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1118  recombinase-related protein  25.51 
 
 		 563 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236338  unclonable  0.000000608507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1644  recombinase  26.15 
 
 		 550 aa  81.3  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0128  Resolvase domain  26.62 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000180819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1409  putative recombinase  25.82 
 
 		 506 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3026  phage recombinase, putative  24.71 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0613972 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3889  recombinase  28.26 
 
 		 560 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0513638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2727  Recombinase  25.97 
 
 		 590 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0143  recombinase  25.36 
 
 		 565 aa  68.2  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4018  hypothetical protein  25.29 
 
 		 539 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3480  recombinase  23.69 
 
 		 532 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000373145  decreased coverage  0.0098808 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0107  recombinase  24.3 
 
 		 544 aa  62.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3310  recombinase  23.75 
 
 		 589 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2440  recombinase  27.08 
 
 		 540 aa  61.6  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2612  recombinase  26.2 
 
 		 601 aa  61.2  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00494  predicted recombinase  25.66 
 
 		 508 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3227  recombinase family protein  25.66 
 
 		 508 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171762  hitchhiker  0.00185611 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3675  Recombinase  26.04 
 
 		 545 aa  57.4  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0003  putative site-specific recombinase  30.39 
 
 		 509 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2774  hypothetical protein  25.17 
 
 		 644 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1905  recombinase  31.01 
 
 		 585 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3468  recombinase  22.16 
 
 		 571 aa  53.9  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2317  hypothetical protein  22.93 
 
 		 534 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3143  resolvase-like:recombinase  24.63 
 
 		 622 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  22.27 
 
 		 542 aa  44.7  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  22.27 
 
 		 542 aa  44.3  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  22.27 
 
 		 542 aa  44.3  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>