142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0231 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0231  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
519 aa  1074    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.829739  normal  0.106092 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  25.25 
 
 
524 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  27.09 
 
 
493 aa  176  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  24.02 
 
 
531 aa  111  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  22.49 
 
 
743 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  25.11 
 
 
558 aa  103  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  29.74 
 
 
525 aa  100  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  29.41 
 
 
539 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  29.08 
 
 
568 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  28.88 
 
 
513 aa  88.6  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1430  Resolvase domain protein  27.56 
 
 
607 aa  87.4  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  26.08 
 
 
550 aa  87.4  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  27.09 
 
 
555 aa  87  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  21.88 
 
 
582 aa  86.7  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  22.72 
 
 
510 aa  83.6  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.39 
 
 
515 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3000  resolvase domain protein  23.53 
 
 
549 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  22.31 
 
 
542 aa  81.3  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  22.31 
 
 
554 aa  81.3  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24.36 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  21.94 
 
 
522 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  25.07 
 
 
445 aa  77  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  22.22 
 
 
517 aa  76.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.86 
 
 
542 aa  76.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.86 
 
 
542 aa  76.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6320  resolvase domain protein  22.32 
 
 
553 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.59 
 
 
542 aa  74.7  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0248  resolvase domain-containing protein  23.59 
 
 
524 aa  75.1  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000541084  hitchhiker  0.00459613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  23.53 
 
 
509 aa  74.7  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25.12 
 
 
445 aa  74.7  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  24.84 
 
 
504 aa  74.7  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  24.27 
 
 
537 aa  73.6  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  24.25 
 
 
534 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  24.27 
 
 
534 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  24 
 
 
534 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  18.31 
 
 
546 aa  72  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  23.82 
 
 
537 aa  70.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  26.14 
 
 
526 aa  70.5  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  21.95 
 
 
563 aa  70.1  0.00000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  24.35 
 
 
445 aa  70.1  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  23.68 
 
 
534 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  23.75 
 
 
534 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  23.56 
 
 
534 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  20.86 
 
 
548 aa  69.3  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2949  site-specific recombinase  24.44 
 
 
479 aa  68.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764647  unclonable  0.00000628307 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.71 
 
 
462 aa  67.8  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.49 
 
 
482 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  21.52 
 
 
537 aa  67.4  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  24.15 
 
 
500 aa  67  0.0000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  23.35 
 
 
546 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  23.31 
 
 
460 aa  67  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  24.09 
 
 
489 aa  66.6  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  24.67 
 
 
546 aa  66.6  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  23.08 
 
 
447 aa  65.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  23.71 
 
 
485 aa  65.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  23.24 
 
 
554 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  22.42 
 
 
525 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0737  resolvase  20.59 
 
 
542 aa  64.7  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0547783  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  20.82 
 
 
613 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  21.9 
 
 
441 aa  62  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  25.24 
 
 
544 aa  61.2  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  23.31 
 
 
558 aa  60.8  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.08 
 
 
494 aa  60.8  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  22.52 
 
 
506 aa  60.8  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  21.9 
 
 
546 aa  60.1  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  21.31 
 
 
487 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  22.79 
 
 
441 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  22.89 
 
 
525 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2975  resolvase domain-containing protein  24.83 
 
 
516 aa  58.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539501  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  20.74 
 
 
421 aa  57.4  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  21.86 
 
 
539 aa  57  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  23.37 
 
 
343 aa  57  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  21.71 
 
 
479 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  25 
 
 
549 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  26.94 
 
 
252 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  22.46 
 
 
532 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  23.08 
 
 
537 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  24.5 
 
 
488 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  21.99 
 
 
539 aa  54.3  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0003  putative site-specific recombinase  23.19 
 
 
509 aa  53.5  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  23.78 
 
 
474 aa  53.5  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  22.88 
 
 
475 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  24.23 
 
 
529 aa  53.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0849  DNA recombinase, putative  25.69 
 
 
494 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  19.24 
 
 
665 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  21.94 
 
 
552 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3472  recombinase  27.07 
 
 
436 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  18.53 
 
 
460 aa  52.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  19.85 
 
 
521 aa  52.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0853  DNA recombinase, putative  25.69 
 
 
494 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000111674 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  21.56 
 
 
459 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1368  recombinase  24.23 
 
 
453 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.118986  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  23.88 
 
 
322 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  23.41 
 
 
465 aa  52  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2325  recombinase  21.06 
 
 
697 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0625  Recombinase  29.01 
 
 
440 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  25.81 
 
 
540 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0609  Recombinase  29.01 
 
 
440 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  23.76 
 
 
272 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  22.53 
 
 
527 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>