21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2108 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4164  hypothetical protein  89.03 
 
 		 501 aa  730    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2108  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  811    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0876721  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4124  recombinase  24.41 
 
 		 432 aa  57  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4086  hypothetical protein  23.37 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4207  Recombinase  24.42 
 
 		 506 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  24.3 
 
 		 460 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6293  recombinase  25.47 
 
 		 385 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  25 
 
 		 534 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  24.84 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.95 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  24.57 
 
 		 534 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  24.73 
 
 		 488 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  24.14 
 
 		 534 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  25.27 
 
 		 534 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  24.57 
 
 		 537 aa  46.2  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  27.5 
 
 		 494 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  27.6 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  24.36 
 
 		 534 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  24.14 
 
 		 534 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  24.14 
 
 		 537 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  24.91 
 
 		 539 aa  43.1  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>