72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3749 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3726  resolvase family site-specific recombinase  100 
 
 
218 aa  440  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3749  site-specific recombinase, resolvase family  100 
 
 
218 aa  440  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1517  site-specific recombinase, resolvase family  100 
 
 
218 aa  440  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.114467 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3445  site-specific recombinase  99.54 
 
 
218 aa  437  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3798  site-specific recombinase, resolvase family  99.54 
 
 
218 aa  437  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3396  site-specific recombinase  99.54 
 
 
218 aa  437  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3707  site-specific recombinase, resolvase family  99.54 
 
 
218 aa  437  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000349891 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3480  resolvase family site-specific recombinase  99.08 
 
 
218 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3753  resolvase family site-specific recombinase  99.08 
 
 
218 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3376  resolvase domain-containing protein  95.87 
 
 
218 aa  425  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2343  resolvase domain-containing protein  90.37 
 
 
218 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0795867  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1238  Resolvase domain protein  67.14 
 
 
217 aa  294  7e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000100955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2120  Resolvase domain protein  62.68 
 
 
217 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11450  Resolvase domain protein  54.13 
 
 
219 aa  208  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000780792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  26.67 
 
 
196 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  29.32 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  29.32 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24.86 
 
 
509 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  25.25 
 
 
537 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2960  DNA resolvase  25.64 
 
 
217 aa  52.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000168825  unclonable  0.00000591562 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2733  Resolvase domain protein  31.78 
 
 
126 aa  52.4  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  30.07 
 
 
515 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  28.15 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1522  Resolvase domain protein  32 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000803569  hitchhiker  0.003356 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  28 
 
 
199 aa  50.1  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.5 
 
 
546 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  27.14 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  27.14 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  28.49 
 
 
193 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  32.82 
 
 
201 aa  48.5  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0738  resolvase domain-containing protein  25.82 
 
 
261 aa  48.5  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0136169  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  24.88 
 
 
206 aa  48.5  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  26.32 
 
 
195 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  25.82 
 
 
188 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  28.1 
 
 
191 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  26.49 
 
 
188 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  25.69 
 
 
201 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1941  putative site-specific recombinase, resolvase family  26.54 
 
 
261 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.292978  normal  0.0530197 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  28.1 
 
 
191 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  27.67 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  27.53 
 
 
189 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3067  resolvase  26.9 
 
 
260 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00040652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1994  resolvase  26.9 
 
 
261 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.854383  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  26.21 
 
 
665 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2201  resolvase family site-specific recombinase  28.48 
 
 
260 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  23.19 
 
 
207 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  25.17 
 
 
546 aa  45.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2045  resolvase family site-specific recombinase  28.48 
 
 
260 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3978  resolvase domain-containing protein  26.38 
 
 
258 aa  45.4  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2033  resolvase domain-containing protein  27.41 
 
 
261 aa  45.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  27.74 
 
 
515 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  26.9 
 
 
194 aa  45.1  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  25 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  31.82 
 
 
475 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  29.11 
 
 
541 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  26.67 
 
 
377 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5600  DNA recombinase, putative, truncation  25.77 
 
 
282 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.13 
 
 
522 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2222  putative site-specific recombinase, resolvase family  27.88 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61199e-51 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  27.1 
 
 
515 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  28.16 
 
 
217 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08120  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  23.49 
 
 
274 aa  43.1  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  normal  0.202082 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  28.76 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  28.76 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  28.76 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  26.67 
 
 
513 aa  42.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  29.63 
 
 
498 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  26 
 
 
641 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  27.63 
 
 
547 aa  42  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  26.57 
 
 
563 aa  42  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  26.21 
 
 
613 aa  42  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  30.77 
 
 
222 aa  41.6  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>