106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_11450 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_11450  Resolvase domain protein  100 
 
 
219 aa  436  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000780792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3376  resolvase domain-containing protein  55.05 
 
 
218 aa  235  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3798  site-specific recombinase, resolvase family  54.59 
 
 
218 aa  234  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2343  resolvase domain-containing protein  53.21 
 
 
218 aa  234  7e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0795867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3726  resolvase family site-specific recombinase  54.13 
 
 
218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3749  site-specific recombinase, resolvase family  54.13 
 
 
218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1517  site-specific recombinase, resolvase family  54.13 
 
 
218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.114467 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3480  resolvase family site-specific recombinase  54.13 
 
 
218 aa  232  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3445  site-specific recombinase  54.13 
 
 
218 aa  232  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3396  site-specific recombinase  54.13 
 
 
218 aa  232  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3753  resolvase family site-specific recombinase  54.13 
 
 
218 aa  232  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3707  site-specific recombinase, resolvase family  54.13 
 
 
218 aa  232  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000349891 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2120  Resolvase domain protein  50 
 
 
217 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1238  Resolvase domain protein  50.68 
 
 
217 aa  221  6e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000100955  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  29.71 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  29.71 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  29.71 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  28.99 
 
 
222 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  27.98 
 
 
189 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  28.02 
 
 
190 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  40.74 
 
 
215 aa  58.9  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  27.33 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  27.33 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  27.75 
 
 
198 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  43.21 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  27.72 
 
 
513 aa  56.6  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  43.21 
 
 
195 aa  56.6  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  41.98 
 
 
195 aa  55.5  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  29.19 
 
 
198 aa  55.5  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  39.05 
 
 
540 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  27.03 
 
 
189 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  25.93 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  26.62 
 
 
229 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  30.2 
 
 
230 aa  52.8  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  25.93 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  25 
 
 
509 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  26.24 
 
 
281 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  25.7 
 
 
185 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  27.34 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  43.75 
 
 
197 aa  50.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  26.62 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4244  resolvase  38.71 
 
 
203 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  22.9 
 
 
201 aa  48.5  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  22.9 
 
 
201 aa  48.5  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  26.19 
 
 
183 aa  48.5  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  26.21 
 
 
563 aa  48.5  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  41.25 
 
 
202 aa  48.5  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1994  resolvase  25 
 
 
261 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.854383  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  33 
 
 
185 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  30.43 
 
 
504 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  25.23 
 
 
196 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  25.34 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  25.34 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  28.03 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  25.67 
 
 
176 aa  47  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  24.89 
 
 
539 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  25.52 
 
 
194 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0738  resolvase domain-containing protein  25 
 
 
261 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0136169  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6376  resolvase domain-containing protein  33.03 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1245  hypothetical protein  29.55 
 
 
127 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00148466  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  25.35 
 
 
188 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1941  putative site-specific recombinase, resolvase family  25 
 
 
261 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.292978  normal  0.0530197 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  26.06 
 
 
504 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  24.88 
 
 
537 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  24 
 
 
515 aa  46.6  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2033  resolvase domain-containing protein  25.46 
 
 
261 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  28.57 
 
 
515 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  30.5 
 
 
195 aa  46.6  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2222  putative site-specific recombinase, resolvase family  24.54 
 
 
261 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61199e-51 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  28.44 
 
 
186 aa  45.4  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  22.47 
 
 
476 aa  45.4  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  27.22 
 
 
184 aa  45.4  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4306  hypothetical protein  50.98 
 
 
70 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  25.32 
 
 
498 aa  45.1  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  29.51 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  37.04 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  23.88 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2733  Resolvase domain protein  29.47 
 
 
126 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08120  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.95 
 
 
274 aa  44.3  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  normal  0.202082 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  28.67 
 
 
542 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  28.67 
 
 
554 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  25.41 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  24.78 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  24.78 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  23.53 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0916  hypothetical protein  29.73 
 
 
110 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000318745 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.41 
 
 
517 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  24.77 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2045  resolvase family site-specific recombinase  25.12 
 
 
260 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2201  resolvase family site-specific recombinase  25.12 
 
 
260 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  35.9 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3978  resolvase domain-containing protein  25.33 
 
 
258 aa  42.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  28.93 
 
 
179 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  23.41 
 
 
183 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  23.41 
 
 
183 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3067  resolvase  24.07 
 
 
260 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00040652  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  20.41 
 
 
377 aa  42.4  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  32.79 
 
 
196 aa  42.7  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  24.44 
 
 
181 aa  42  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  24.31 
 
 
190 aa  42  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>