85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1522 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1522  Resolvase domain protein  100 
 
 
234 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000803569  hitchhiker  0.003356 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2733  Resolvase domain protein  57.39 
 
 
126 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2421  hypothetical protein  45.69 
 
 
123 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  37.14 
 
 
196 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  38.1 
 
 
195 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2120  Resolvase domain protein  34.31 
 
 
217 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  32.04 
 
 
525 aa  55.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  30.77 
 
 
542 aa  55.1  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  30.77 
 
 
542 aa  55.1  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  35.09 
 
 
515 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  29.81 
 
 
542 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  31.37 
 
 
539 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  33.94 
 
 
212 aa  52.4  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  30.1 
 
 
568 aa  52  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  29.09 
 
 
539 aa  52  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3396  site-specific recombinase  32 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1238  Resolvase domain protein  29.7 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000100955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3445  site-specific recombinase  32 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  27.34 
 
 
526 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3480  resolvase family site-specific recombinase  32 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3753  resolvase family site-specific recombinase  32 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3707  site-specific recombinase, resolvase family  32 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000349891 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3376  resolvase domain-containing protein  33 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  28.97 
 
 
485 aa  50.4  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3726  resolvase family site-specific recombinase  32 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3749  site-specific recombinase, resolvase family  32 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3798  site-specific recombinase, resolvase family  32 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1517  site-specific recombinase, resolvase family  32 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.114467 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  30 
 
 
515 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  32.38 
 
 
509 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  29.46 
 
 
546 aa  48.9  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  28.44 
 
 
522 aa  49.3  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  40 
 
 
475 aa  48.9  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  27.52 
 
 
522 aa  48.9  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  34.65 
 
 
201 aa  48.5  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  34.65 
 
 
201 aa  48.5  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  31.68 
 
 
511 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2343  resolvase domain-containing protein  29 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0795867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  30.28 
 
 
519 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  29.27 
 
 
429 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  28.16 
 
 
513 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  30.43 
 
 
613 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1218  putative invertase  47.54 
 
 
183 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08120  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  33.33 
 
 
274 aa  46.6  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  normal  0.202082 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  24.14 
 
 
543 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  25.22 
 
 
626 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  25.45 
 
 
576 aa  45.4  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  28.32 
 
 
558 aa  45.4  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  43.86 
 
 
185 aa  45.4  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  26.13 
 
 
520 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  25.93 
 
 
565 aa  45.1  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  24.78 
 
 
506 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.92 
 
 
494 aa  44.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  25.93 
 
 
549 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0737  resolvase  27.78 
 
 
542 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0547783  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  25.83 
 
 
521 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  25.83 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  34.18 
 
 
475 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  28.57 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  31.86 
 
 
283 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  43.33 
 
 
189 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  30.68 
 
 
665 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  43.33 
 
 
189 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  30.86 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  32.43 
 
 
196 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  41.54 
 
 
193 aa  42.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  26.42 
 
 
206 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  42.19 
 
 
185 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  25 
 
 
534 aa  43.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  32.43 
 
 
196 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  32.43 
 
 
196 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  29.91 
 
 
541 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  38.89 
 
 
537 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  27.12 
 
 
431 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  40.98 
 
 
181 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  23.81 
 
 
580 aa  42.4  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  25 
 
 
526 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  22.11 
 
 
449 aa  42.4  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  22.11 
 
 
449 aa  42.4  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  40.62 
 
 
183 aa  42  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.24 
 
 
462 aa  42  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  33.33 
 
 
550 aa  42  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  26.17 
 
 
540 aa  42  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  23.73 
 
 
862 aa  42  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  60 
 
 
204 aa  41.6  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>