138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2120 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2120  Resolvase domain protein  100 
 
 		 217 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1238  Resolvase domain protein  76.3 
 
 		 217 aa  335  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000100955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3376  resolvase domain-containing protein  63.16 
 
 		 218 aa  278  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3480  resolvase family site-specific recombinase  62.68 
 
 		 218 aa  276  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3445  site-specific recombinase  62.68 
 
 		 218 aa  276  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3396  site-specific recombinase  62.68 
 
 		 218 aa  276  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3753  resolvase family site-specific recombinase  62.68 
 
 		 218 aa  276  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3798  site-specific recombinase, resolvase family  62.68 
 
 		 218 aa  276  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3707  site-specific recombinase, resolvase family  62.68 
 
 		 218 aa  276  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000349891 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3726  resolvase family site-specific recombinase  62.68 
 
 		 218 aa  276  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2343  resolvase domain-containing protein  61.72 
 
 		 218 aa  276  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0795867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3749  site-specific recombinase, resolvase family  62.68 
 
 		 218 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1517  site-specific recombinase, resolvase family  62.68 
 
 		 218 aa  276  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.114467 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11450  Resolvase domain protein  50 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000780792  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  35.82 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  35.82 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  34.81 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  31.37 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  29.5 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  24.22 
 
 		 539 aa  60.1  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2733  Resolvase domain protein  32.04 
 
 		 126 aa  60.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  27.83 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  27.83 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  28.1 
 
 		 462 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  30.2 
 
 		 515 aa  58.2  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1522  Resolvase domain protein  34.31 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000803569  hitchhiker  0.003356 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  32.67 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.3 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  29.61 
 
 		 665 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  29.22 
 
 		 377 aa  55.5  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  26.85 
 
 		 546 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.35 
 
 		 494 aa  52.8  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  26.44 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  25.66 
 
 		 551 aa  52.4  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  32.39 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  27.52 
 
 		 546 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  26.59 
 
 		 522 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  27.14 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  27.17 
 
 		 522 aa  51.2  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  29.33 
 
 		 520 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  27.55 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  27.55 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  27.55 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  39.51 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  26.88 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  25.18 
 
 		 550 aa  50.1  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  28.95 
 
 		 613 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  39.51 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  27.57 
 
 		 183 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  32.17 
 
 		 460 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  27.45 
 
 		 511 aa  49.3  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  29.33 
 
 		 521 aa  49.7  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  26.12 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  32.1 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  29.6 
 
 		 543 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  32.1 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  28.57 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  30.13 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1138  resolvase-like protein  26.42 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00747364  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  27.07 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08120  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  23.67 
 
 		 274 aa  47  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  normal  0.202082 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  29.61 
 
 		 526 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2960  DNA resolvase  23.86 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000168825  unclonable  0.00000591562 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  25.97 
 
 		 553 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  28.76 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.84 
 
 		 517 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  27.08 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  28.39 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  28.39 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  27.81 
 
 		 519 aa  47  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0028  recombinase  29.94 
 
 		 537 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  28.89 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  32.87 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  28.76 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0526  recombinase  28.66 
 
 		 524 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  24.67 
 
 		 606 aa  46.6  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  33.59 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  24.67 
 
 		 606 aa  46.6  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0075  recombinase  28.21 
 
 		 521 aa  46.2  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.243508  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  29.41 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  29.41 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  29.41 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2746  recombinase  28.51 
 
 		 528 aa  45.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  27.33 
 
 		 540 aa  45.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  25.49 
 
 		 475 aa  45.4  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  27.7 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  29.13 
 
 		 526 aa  45.4  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1967  resolvase domain-containing protein  31.87 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0916  hypothetical protein  36.36 
 
 		 110 aa  45.4  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000318745 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  31.65 
 
 		 185 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  29.03 
 
 		 515 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  30.53 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  25.52 
 
 		 518 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  25 
 
 		 561 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3312  resolvase-like protein  28.31 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0585  resolvase-like protein  28.68 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.698292  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  36.14 
 
 		 467 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  27.27 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  25.96 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  23.84 
 
 		 539 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>