38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0196 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0196  putative site-specific integrase-resolvase, degenerate  100 
 
 		 63 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000193839  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  92.06 
 
 		 208 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  46.03 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  44.44 
 
 		 229 aa  67.4  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  44.44 
 
 		 229 aa  67.4  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  42.86 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  34.92 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  40 
 
 		 207 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  36.51 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  38.1 
 
 		 215 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  38.1 
 
 		 215 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  38.1 
 
 		 209 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  41.27 
 
 		 204 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 215 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  38.1 
 
 		 197 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  36.51 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  39.34 
 
 		 194 aa  46.2  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  36.51 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  37.7 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  34.92 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  37.21 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  39.34 
 
 		 193 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  31.75 
 
 		 207 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  39.34 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  37.7 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  37.7 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  33.33 
 
 		 196 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  34.43 
 
 		 193 aa  43.9  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  31.75 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  36.51 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 222 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  31.75 
 
 		 208 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  30.65 
 
 		 197 aa  40.4  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  31.75 
 
 		 195 aa  40.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  34.38 
 
 		 190 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  34.38 
 
 		 190 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 197 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>