19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4306 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4306  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  54 
 
 
213 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  54 
 
 
213 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  44.64 
 
 
206 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  39.29 
 
 
201 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  39.29 
 
 
201 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  48 
 
 
196 aa  46.6  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 
215 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  53.19 
 
 
245 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  53.19 
 
 
245 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  37.5 
 
 
209 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  36.54 
 
 
212 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  39.22 
 
 
207 aa  41.6  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  35.62 
 
 
563 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  41.82 
 
 
301 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  37.5 
 
 
222 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  37.5 
 
 
222 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2960  DNA resolvase  44.19 
 
 
217 aa  40  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000168825  unclonable  0.00000591562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  40 
 
 
222 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>