More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0950 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 207 aa  420  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  52.63 
 
 		 206 aa  205  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  51.18 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  51.24 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  53.69 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  51.72 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  52.2 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  50 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  48.26 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  48.26 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  50.97 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  50.24 
 
 		 206 aa  179  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  53.69 
 
 		 208 aa  177  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  53.2 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  46.34 
 
 		 211 aa  174  7e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  47.14 
 
 		 231 aa  170  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  43.9 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  45.41 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  47.29 
 
 		 209 aa  164  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  47.29 
 
 		 212 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  46.38 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  46.31 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  46.8 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  46.86 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  43.96 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  49.14 
 
 		 213 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  44.33 
 
 		 213 aa  158  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  43.2 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  42.36 
 
 		 220 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  40.3 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  41.31 
 
 		 222 aa  138  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  39.8 
 
 		 204 aa  134  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  42.44 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  37.75 
 
 		 198 aa  124  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  37.81 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  35.2 
 
 		 190 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  33.18 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  33.17 
 
 		 245 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  34.95 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  33 
 
 		 283 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  43.69 
 
 		 138 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  29.19 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  31.55 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  31.05 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  27.45 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0026  resolvase family site-specific recombinase  45.45 
 
 		 102 aa  64.7  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122476  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2019  resolvase family site-specific recombinase  45.24 
 
 		 91 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  29.01 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  31.49 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  27.86 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  26.47 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  28.21 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  27.05 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  30.29 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  31.64 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  27.36 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  28.22 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  29.83 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  28.75 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  28.79 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  26.37 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  30.82 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  26.87 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  30.82 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  27.4 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  26.47 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  26.47 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  27.47 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  27.23 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  26.63 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  28.36 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  27.72 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  25.87 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  31.34 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  24.51 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  26.13 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  25.73 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  30.1 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2509  putative res  65.79 
 
 		 41 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.963906 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  28.17 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  28.36 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  28.36 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  28.36 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  29.01 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  29.21 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  28.64 
 
 		 318 aa  52.4  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  27.05 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  24.63 
 
 		 182 aa  52.4  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  28.29 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  25.98 
 
 		 190 aa  51.6  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  26.74 
 
 		 183 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  25.25 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  31.12 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  29.53 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  25.74 
 
 		 189 aa  51.6  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  26.74 
 
 		 183 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>