80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2084 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  100 
 
 		 94 aa  188  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  52.86 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  52.11 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  52.11 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  47.69 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  46.88 
 
 		 208 aa  60.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  40.91 
 
 		 212 aa  60.5  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  51.56 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  51.56 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  51.56 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  51.56 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  41.07 
 
 		 279 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  48.39 
 
 		 203 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  48.39 
 
 		 203 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  36.23 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  51.56 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  51.56 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  50.77 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  49.25 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  49.25 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  46.55 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0517  DNA binding domain protein, excisionase family  47.17 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  43.94 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  36.59 
 
 		 201 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  55.81 
 
 		 201 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  47.76 
 
 		 229 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 222 aa  50.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2025  DNA binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  43.08 
 
 		 215 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 201 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  42.86 
 
 		 213 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  42.86 
 
 		 213 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  42.25 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  38.1 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  42.25 
 
 		 222 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  42.65 
 
 		 197 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  46.51 
 
 		 192 aa  47.8  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  44.62 
 
 		 215 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  44.62 
 
 		 215 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3543  DNA binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 207 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000932058  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  44.68 
 
 		 185 aa  47  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  40.85 
 
 		 209 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  40.85 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  41.79 
 
 		 202 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  45.28 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 319 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  41.38 
 
 		 197 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  41.3 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1745  DNA binding domain-containing protein  42.31 
 
 		 205 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  36.92 
 
 		 206 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  46 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  36.92 
 
 		 206 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  40.62 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  37.1 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 302 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0161  DNA binding domain-containing protein  37.1 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  36.54 
 
 		 156 aa  42.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 298 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  43.4 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  41.18 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03000  DNA-binding protein, excisionase family  44.44 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  38.71 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  45 
 
 		 295 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  40.98 
 
 		 148 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  41.67 
 
 		 67 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0693  DNA binding domain protein, excisionase family  36.96 
 
 		 79 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0633565  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 321 aa  41.2  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  41.18 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 282 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  36.51 
 
 		 192 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  33.87 
 
 		 195 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  44.68 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  41.18 
 
 		 195 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  39.62 
 
 		 207 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  32.35 
 
 		 201 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  36.51 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  36.51 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  44.19 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 245 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  37.1 
 
 		 195 aa  40  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>