64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03000 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_03000  DNA-binding protein, excisionase family  100 
 
 		 69 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  79.71 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0931  DNA binding domain protein, excisionase family  79.37 
 
 		 68 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  78.57 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  88.68 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  88.68 
 
 		 68 aa  95.9  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  73.13 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  86.79 
 
 		 73 aa  95.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0819  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  93.88 
 
 		 65 aa  94.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  82.14 
 
 		 74 aa  93.2  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  84.62 
 
 		 67 aa  90.9  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  87.76 
 
 		 64 aa  90.5  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34060  DNA-binding protein, excisionase family  70.18 
 
 		 76 aa  84.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.910239  normal  0.267084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0693  DNA binding domain protein, excisionase family  72.73 
 
 		 79 aa  83.6  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0633565  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2159  DNA binding domain protein, excisionase family  75 
 
 		 72 aa  83.6  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  68.33 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  77.08 
 
 		 71 aa  80.9  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2751  excisionase/Xis, DNA-binding  66.67 
 
 		 67 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0704152  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3086  DNA binding domain protein, excisionase family  77.08 
 
 		 69 aa  80.1  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4391  DNA binding domain protein, excisionase family  66.67 
 
 		 67 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0294  DNA binding domain protein, excisionase family  66.67 
 
 		 67 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3348  excisionase family DNA binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 67 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.401166 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  75 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2349  DNA binding domain protein, excisionase family  70.83 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0161  DNA binding domain-containing protein  75 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8997  hypothetical protein  75.51 
 
 		 67 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.944138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2068  DNA binding domain-containing protein  75 
 
 		 69 aa  77.8  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0099  excisionase/Xis, DNA-binding  75 
 
 		 68 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7205  DNA binding domain-containing protein  75 
 
 		 68 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0300475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0301  DNA binding domain protein, excisionase family  75 
 
 		 67 aa  76.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4385  DNA binding domain-containing protein  75 
 
 		 83 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1042  DNA binding domain protein, excisionase family  72.34 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08990  DNA-binding protein, excisionase family  61.11 
 
 		 72 aa  72.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269526  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9401  hypothetical protein  61.54 
 
 		 74 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  56 
 
 		 212 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4676  DNA binding domain protein, excisionase family  58.33 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  48.98 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  53.06 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  43.1 
 
 		 279 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1644  regulatory protein MerR  53.66 
 
 		 41 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  52.27 
 
 		 203 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  52.27 
 
 		 203 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  40.98 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  48.89 
 
 		 216 aa  47.4  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  35 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  41.3 
 
 		 195 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  35 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1938  excisionase family DNA-binding response regulator  38.1 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  47.73 
 
 		 201 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  46.94 
 
 		 219 aa  44.3  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  43.48 
 
 		 201 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  46.94 
 
 		 219 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  39.29 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  44.44 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3366  DNA binding domain protein, excisionase family  32 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2583  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.011334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2771  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3543  DNA binding domain-containing protein  36.21 
 
 		 207 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000932058  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1872  hypothetical protein  38 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1649  hypothetical protein  38 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0606557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  30 
 
 		 197 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  44.74 
 
 		 295 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1745  DNA binding domain-containing protein  45.65 
 
 		 205 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>