63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3086 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3086  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
69 aa  138  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34060  DNA-binding protein, excisionase family  94.34 
 
 
76 aa  103  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.910239  normal  0.267084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  74.6 
 
 
71 aa  101  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2068  DNA binding domain-containing protein  88.68 
 
 
69 aa  99  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0294  DNA binding domain protein, excisionase family  88.68 
 
 
67 aa  98.6  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0099  excisionase/Xis, DNA-binding  80.33 
 
 
68 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7205  DNA binding domain-containing protein  80.33 
 
 
68 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0300475  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  90.38 
 
 
69 aa  97.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0161  DNA binding domain-containing protein  90.38 
 
 
69 aa  97.8  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177228  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2751  excisionase/Xis, DNA-binding  80.33 
 
 
67 aa  97.4  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0704152  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3348  excisionase family DNA binding domain-containing protein  86.79 
 
 
67 aa  97.1  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.401166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4391  DNA binding domain protein, excisionase family  80.33 
 
 
67 aa  97.1  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8997  hypothetical protein  86.79 
 
 
67 aa  97.1  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2349  DNA binding domain protein, excisionase family  80.36 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0301  DNA binding domain protein, excisionase family  84.91 
 
 
67 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  86.54 
 
 
75 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4385  DNA binding domain-containing protein  73.02 
 
 
83 aa  94  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  78.95 
 
 
64 aa  87.8  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  65.67 
 
 
68 aa  86.7  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  71.88 
 
 
79 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2159  DNA binding domain protein, excisionase family  70.97 
 
 
72 aa  86.3  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  74.55 
 
 
73 aa  85.9  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  80.39 
 
 
67 aa  86.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  81.25 
 
 
88 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0819  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  75 
 
 
65 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  81.25 
 
 
90 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  66.67 
 
 
72 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  68.97 
 
 
74 aa  82.8  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0931  DNA binding domain protein, excisionase family  74.51 
 
 
68 aa  80.5  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08990  DNA-binding protein, excisionase family  71.7 
 
 
72 aa  80.5  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03000  DNA-binding protein, excisionase family  77.08 
 
 
69 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0693  DNA binding domain protein, excisionase family  65.38 
 
 
79 aa  73.9  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0633565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1042  DNA binding domain protein, excisionase family  63.46 
 
 
82 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1644  regulatory protein MerR  72.5 
 
 
41 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356829  normal 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9401  hypothetical protein  57.63 
 
 
74 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  61.22 
 
 
212 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4676  DNA binding domain protein, excisionase family  52.63 
 
 
80 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  42.11 
 
 
192 aa  53.9  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  51.92 
 
 
185 aa  54.3  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  41.27 
 
 
279 aa  50.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  45.65 
 
 
203 aa  48.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  45.65 
 
 
203 aa  48.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  43.4 
 
 
201 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1649  hypothetical protein  40 
 
 
71 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0606557  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  43.14 
 
 
206 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  43.14 
 
 
206 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  48.08 
 
 
219 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  45.45 
 
 
201 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5448  hypothetical protein  40 
 
 
71 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.289379  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  41.51 
 
 
201 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  45.1 
 
 
216 aa  43.9  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  46.15 
 
 
219 aa  43.5  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1872  hypothetical protein  38.71 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2771  hypothetical protein  40.68 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604646  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
197 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3543  DNA binding domain-containing protein  41.67 
 
 
207 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000932058  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  42.5 
 
 
195 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2583  hypothetical protein  38.98 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.011334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  40 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1938  excisionase family DNA-binding response regulator  43.18 
 
 
190 aa  41.2  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3366  DNA binding domain protein, excisionase family  29.31 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  31.48 
 
 
202 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  47.37 
 
 
209 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>