62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0161 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0161  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 
69 aa  142  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177228  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 
69 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  83.82 
 
 
75 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8997  hypothetical protein  84.85 
 
 
67 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0294  DNA binding domain protein, excisionase family  84.85 
 
 
67 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3348  excisionase family DNA binding domain-containing protein  84.85 
 
 
67 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.401166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2751  excisionase/Xis, DNA-binding  82.09 
 
 
67 aa  111  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0704152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4391  DNA binding domain protein, excisionase family  83.33 
 
 
67 aa  111  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0301  DNA binding domain protein, excisionase family  80.88 
 
 
67 aa  110  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0099  excisionase/Xis, DNA-binding  83.33 
 
 
68 aa  106  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7205  DNA binding domain-containing protein  83.33 
 
 
68 aa  106  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0300475  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2068  DNA binding domain-containing protein  80.3 
 
 
69 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  75 
 
 
71 aa  100  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3086  DNA binding domain protein, excisionase family  90.38 
 
 
69 aa  97.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34060  DNA-binding protein, excisionase family  81.03 
 
 
76 aa  97.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.910239  normal  0.267084 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2349  DNA binding domain protein, excisionase family  77.97 
 
 
79 aa  96.7  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2159  DNA binding domain protein, excisionase family  76.27 
 
 
72 aa  94.4  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  67.69 
 
 
67 aa  92  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4385  DNA binding domain-containing protein  78.85 
 
 
83 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0819  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  71.43 
 
 
65 aa  88.6  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  71.19 
 
 
68 aa  88.2  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  69.49 
 
 
88 aa  88.2  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  77.36 
 
 
64 aa  87.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  76.47 
 
 
90 aa  87  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  75.47 
 
 
73 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  75.47 
 
 
79 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  74.51 
 
 
74 aa  85.1  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  70.37 
 
 
72 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0931  DNA binding domain protein, excisionase family  78 
 
 
68 aa  81.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08990  DNA-binding protein, excisionase family  77.55 
 
 
72 aa  80.9  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03000  DNA-binding protein, excisionase family  75 
 
 
69 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0693  DNA binding domain protein, excisionase family  60.71 
 
 
79 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0633565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1042  DNA binding domain protein, excisionase family  66.67 
 
 
82 aa  70.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1644  regulatory protein MerR  70 
 
 
41 aa  64.3  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356829  normal 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9401  hypothetical protein  64.71 
 
 
74 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4676  DNA binding domain protein, excisionase family  52.63 
 
 
80 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  56 
 
 
212 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  44.07 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  44.9 
 
 
192 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  46.81 
 
 
203 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  46.81 
 
 
203 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  38.6 
 
 
279 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  39.66 
 
 
206 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  39.66 
 
 
206 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 
201 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0733  response regulator receiver protein  52.94 
 
 
215 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  42.22 
 
 
201 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  44.26 
 
 
219 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  42.22 
 
 
201 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  47.27 
 
 
219 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  43.64 
 
 
216 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3366  DNA binding domain protein, excisionase family  38.3 
 
 
71 aa  43.5  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1938  excisionase family DNA-binding response regulator  43.18 
 
 
190 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3543  DNA binding domain-containing protein  37.29 
 
 
207 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000932058  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  37.1 
 
 
94 aa  42.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  50 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2771  hypothetical protein  39.62 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604646  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  37.25 
 
 
77 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  44.74 
 
 
195 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28720  hypothetical protein  42.59 
 
 
60 aa  41.2  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.801699 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  47.37 
 
 
295 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2583  hypothetical protein  37.74 
 
 
70 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.011334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>