28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1745 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1745  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2025  DNA binding domain-containing protein  85.85 
 
 		 206 aa  335  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3543  DNA binding domain-containing protein  54.77 
 
 		 207 aa  209  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000932058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0517  DNA binding domain protein, excisionase family  35.85 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  51.06 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  48 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  45.1 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  47.06 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  47.06 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  43.14 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  39.22 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0733  response regulator receiver protein  29.33 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  42.59 
 
 		 127 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08990  DNA-binding protein, excisionase family  37.74 
 
 		 72 aa  43.5  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  42.31 
 
 		 94 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  52.94 
 
 		 136 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  38.46 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  38.46 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  36 
 
 		 90 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  41.18 
 
 		 295 aa  42  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4391  DNA binding domain protein, excisionase family  44.23 
 
 		 67 aa  42  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34060  DNA-binding protein, excisionase family  42.86 
 
 		 76 aa  41.6  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.910239  normal  0.267084 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2349  DNA binding domain protein, excisionase family  38 
 
 		 79 aa  42  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7205  DNA binding domain-containing protein  44.9 
 
 		 68 aa  41.6  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0300475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0099  excisionase/Xis, DNA-binding  44.9 
 
 		 68 aa  41.6  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2751  excisionase/Xis, DNA-binding  44.23 
 
 		 67 aa  42  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0704152  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  46.67 
 
 		 68 aa  41.6  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  42 
 
 		 71 aa  41.6  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>