103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6401 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 279 aa  553  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  30.88 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  50.98 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  26.51 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  41.07 
 
 		 94 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0693  DNA binding domain protein, excisionase family  52.83 
 
 		 79 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0633565  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3543  DNA binding domain-containing protein  38.81 
 
 		 207 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000932058  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  44.62 
 
 		 68 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  42.03 
 
 		 90 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  26.48 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  46.43 
 
 		 79 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0733  response regulator receiver protein  53.06 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  49.02 
 
 		 64 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  48.98 
 
 		 192 aa  53.1  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  46.43 
 
 		 74 aa  53.1  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0819  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  49.02 
 
 		 65 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  41.94 
 
 		 67 aa  52.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  22.78 
 
 		 294 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5042  excisionase/Xis, DNA-binding  54.17 
 
 		 198 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  23.28 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.03 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  45.28 
 
 		 203 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03000  DNA-binding protein, excisionase family  43.1 
 
 		 69 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  45.28 
 
 		 203 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0931  DNA binding domain protein, excisionase family  41.07 
 
 		 68 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  37.7 
 
 		 185 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  45.1 
 
 		 201 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  22.41 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  46.15 
 
 		 88 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0517  DNA binding domain protein, excisionase family  51.22 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  41.38 
 
 		 72 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3086  DNA binding domain protein, excisionase family  41.27 
 
 		 69 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  26.34 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  37.74 
 
 		 216 aa  50.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  37.29 
 
 		 206 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  37.29 
 
 		 206 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1042  DNA binding domain protein, excisionase family  41.51 
 
 		 82 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  47.73 
 
 		 201 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  43.14 
 
 		 219 aa  49.3  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2025  DNA binding domain-containing protein  38.18 
 
 		 206 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  26.89 
 
 		 324 aa  48.9  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  26.5 
 
 		 315 aa  48.9  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  43.14 
 
 		 219 aa  48.9  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2479  putative GAF sensor protein  47.06 
 
 		 363 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.376583 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2068  DNA binding domain-containing protein  42.31 
 
 		 69 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2349  DNA binding domain protein, excisionase family  43.75 
 
 		 79 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  38.71 
 
 		 137 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0161  DNA binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 69 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 69 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  40.43 
 
 		 195 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2751  excisionase/Xis, DNA-binding  40 
 
 		 67 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0704152  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2239  response regulator receiver protein  48.08 
 
 		 209 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  hitchhiker  0.0000034786 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1745  DNA binding domain-containing protein  39.22 
 
 		 205 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  35.71 
 
 		 75 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  43.33 
 
 		 71 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0562  excisionase/Xis, DNA-binding  45.1 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  30.93 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08990  DNA-binding protein, excisionase family  44.9 
 
 		 72 aa  46.6  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0294  DNA binding domain protein, excisionase family  40.38 
 
 		 67 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8997  hypothetical protein  40.38 
 
 		 67 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.944138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3348  excisionase family DNA binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 67 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.401166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  26.39 
 
 		 209 aa  46.2  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4391  DNA binding domain protein, excisionase family  39.66 
 
 		 67 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0301  DNA binding domain protein, excisionase family  40.38 
 
 		 67 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 316 aa  45.8  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  26.92 
 
 		 1190 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0099  excisionase/Xis, DNA-binding  41.18 
 
 		 68 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  42.31 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7205  DNA binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 68 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0300475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1874  response regulator receiver protein  53.49 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  27.54 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  29.67 
 
 		 801 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34060  DNA-binding protein, excisionase family  40.35 
 
 		 76 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.910239  normal  0.267084 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  25.93 
 
 		 804 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.36 
 
 		 370 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1915  putative transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 166 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0967  cobalamin B12-binding domain protein  27.61 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502888  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  24.83 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  38 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  38 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2159  DNA binding domain protein, excisionase family  45.83 
 
 		 72 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  22.95 
 
 		 793 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0291  cobalamin B12-binding domain protein  24.75 
 
 		 356 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2387  B12-binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 226 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  23.64 
 
 		 804 aa  43.5  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2670  excisionase/Xis, DNA-binding  27.42 
 
 		 219 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 333 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  42.86 
 
 		 77 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  22.67 
 
 		 820 aa  43.1  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  36.62 
 
 		 216 aa  42.7  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  36.62 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  36.62 
 
 		 216 aa  42.7  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0238  hypothetical protein  28.71 
 
 		 320 aa  42.7  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  35.42 
 
 		 209 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  32.31 
 
 		 213 aa  42.4  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  32.31 
 
 		 213 aa  42.4  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>