69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2349 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2349  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 79 aa  164  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34060  DNA-binding protein, excisionase family  72 
 
 		 76 aa  116  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.910239  normal  0.267084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0161  DNA binding domain-containing protein  77.97 
 
 		 69 aa  96.7  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  77.97 
 
 		 69 aa  96.7  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  62.03 
 
 		 75 aa  95.5  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3086  DNA binding domain protein, excisionase family  80.36 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3348  excisionase family DNA binding domain-containing protein  75.86 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.401166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8997  hypothetical protein  75.86 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.944138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0294  DNA binding domain protein, excisionase family  75.86 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  81.13 
 
 		 71 aa  94.4  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2751  excisionase/Xis, DNA-binding  74.14 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0704152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4391  DNA binding domain protein, excisionase family  74.14 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2068  DNA binding domain-containing protein  80.77 
 
 		 69 aa  92.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7205  DNA binding domain-containing protein  71.19 
 
 		 68 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0300475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0301  DNA binding domain protein, excisionase family  74.14 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0099  excisionase/Xis, DNA-binding  71.19 
 
 		 68 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  68.52 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4385  DNA binding domain-containing protein  68.52 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  68.52 
 
 		 88 aa  84.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  63.93 
 
 		 73 aa  84.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2159  DNA binding domain protein, excisionase family  72.55 
 
 		 72 aa  84  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08990  DNA-binding protein, excisionase family  67.24 
 
 		 72 aa  82.8  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  61.67 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  66.1 
 
 		 67 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  72.55 
 
 		 64 aa  81.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  72 
 
 		 68 aa  80.9  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  63.33 
 
 		 72 aa  80.9  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0819  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  64.15 
 
 		 65 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03000  DNA-binding protein, excisionase family  70.83 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0931  DNA binding domain protein, excisionase family  69.23 
 
 		 68 aa  79.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 74 aa  77.8  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0693  DNA binding domain protein, excisionase family  56.36 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0633565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1042  DNA binding domain protein, excisionase family  62.5 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1644  regulatory protein MerR  65 
 
 		 41 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4676  DNA binding domain protein, excisionase family  54.17 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9401  hypothetical protein  53.85 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  52 
 
 		 212 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  54 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  37.7 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  45.31 
 
 		 206 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  45.31 
 
 		 206 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  44.68 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  44.68 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  43.75 
 
 		 279 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  43.18 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1938  excisionase family DNA-binding response regulator  34.25 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  43.48 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  40.91 
 
 		 201 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3543  DNA binding domain-containing protein  38.3 
 
 		 207 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000932058  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0733  response regulator receiver protein  43.64 
 
 		 215 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  37.1 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  44 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2771  hypothetical protein  38.78 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2583  hypothetical protein  38.78 
 
 		 70 aa  42  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.011334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1872  hypothetical protein  38.78 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1649  hypothetical protein  38.78 
 
 		 71 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0606557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1745  DNA binding domain-containing protein  38 
 
 		 205 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  42 
 
 		 216 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  35.42 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  37.5 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1161  MerR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.137499  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  38.46 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1131  DNA-binding protein, excisionase family  41.51 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0470185  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1349  excisionase family DNA-binding protein  42.59 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000764481  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2025  DNA binding domain-containing protein  36 
 
 		 206 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3640  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 207 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.196846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3714  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 207 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3366  DNA binding domain protein, excisionase family  31.91 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>