41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1644 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1644  regulatory protein MerR  100 
 
 
41 aa  83.6  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356829  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0294  DNA binding domain protein, excisionase family  79.49 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0301  DNA binding domain protein, excisionase family  77.5 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0099  excisionase/Xis, DNA-binding  77.5 
 
 
68 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7205  DNA binding domain-containing protein  77.5 
 
 
68 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0300475  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2751  excisionase/Xis, DNA-binding  76.92 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0704152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4391  DNA binding domain protein, excisionase family  76.92 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3348  excisionase family DNA binding domain-containing protein  76.92 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.401166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8997  hypothetical protein  76.92 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2068  DNA binding domain-containing protein  75 
 
 
69 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4385  DNA binding domain-containing protein  76.92 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3086  DNA binding domain protein, excisionase family  72.5 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  70 
 
 
71 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  70 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0161  DNA binding domain-containing protein  70 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177228  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  65.85 
 
 
75 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2159  DNA binding domain protein, excisionase family  70 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34060  DNA-binding protein, excisionase family  69.23 
 
 
76 aa  61.6  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.910239  normal  0.267084 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2349  DNA binding domain protein, excisionase family  65 
 
 
79 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  61.54 
 
 
64 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  60 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  60 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  61.54 
 
 
88 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  61.54 
 
 
74 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0819  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  60 
 
 
65 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0931  DNA binding domain protein, excisionase family  58.54 
 
 
68 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  58.97 
 
 
68 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  58.97 
 
 
73 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  58.97 
 
 
79 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  56.1 
 
 
72 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  64.1 
 
 
212 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0693  DNA binding domain protein, excisionase family  60.98 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0633565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1042  DNA binding domain protein, excisionase family  60 
 
 
82 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08990  DNA-binding protein, excisionase family  64.1 
 
 
72 aa  51.2  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03000  DNA-binding protein, excisionase family  53.66 
 
 
69 aa  50.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4676  DNA binding domain protein, excisionase family  58.97 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  52.5 
 
 
201 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  42.5 
 
 
203 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  42.5 
 
 
203 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  43.9 
 
 
279 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  45.71 
 
 
201 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>