59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3348 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3348  excisionase family DNA binding domain-containing protein  100 
 
 
67 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.401166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8997  hypothetical protein  98.51 
 
 
67 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0294  DNA binding domain protein, excisionase family  98.51 
 
 
67 aa  133  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2751  excisionase/Xis, DNA-binding  97.01 
 
 
67 aa  131  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0704152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4391  DNA binding domain protein, excisionase family  95.52 
 
 
67 aa  130  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0301  DNA binding domain protein, excisionase family  92.31 
 
 
67 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2068  DNA binding domain-containing protein  90.91 
 
 
69 aa  121  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0099  excisionase/Xis, DNA-binding  85.07 
 
 
68 aa  118  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7205  DNA binding domain-containing protein  85.07 
 
 
68 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0300475  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0161  DNA binding domain-containing protein  84.85 
 
 
69 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177228  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  84.85 
 
 
69 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  80.33 
 
 
71 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  82.76 
 
 
75 aa  100  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3086  DNA binding domain protein, excisionase family  86.79 
 
 
69 aa  97.1  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34060  DNA-binding protein, excisionase family  77.97 
 
 
76 aa  97.1  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.910239  normal  0.267084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2159  DNA binding domain protein, excisionase family  75 
 
 
72 aa  95.5  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4385  DNA binding domain-containing protein  81.82 
 
 
83 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2349  DNA binding domain protein, excisionase family  75.86 
 
 
79 aa  94.7  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  70.18 
 
 
64 aa  87.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  80 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  75 
 
 
67 aa  84.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08990  DNA-binding protein, excisionase family  73.68 
 
 
72 aa  84.3  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269526  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  73.58 
 
 
73 aa  84.3  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0819  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  72.22 
 
 
65 aa  84  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  78 
 
 
90 aa  83.6  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  73.58 
 
 
68 aa  83.6  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  73.58 
 
 
79 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0931  DNA binding domain protein, excisionase family  75.47 
 
 
68 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  76 
 
 
74 aa  82.4  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03000  DNA-binding protein, excisionase family  66.67 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  63.33 
 
 
72 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0693  DNA binding domain protein, excisionase family  65.38 
 
 
79 aa  73.6  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0633565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1042  DNA binding domain protein, excisionase family  68.09 
 
 
82 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1644  regulatory protein MerR  76.92 
 
 
41 aa  65.5  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356829  normal 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9401  hypothetical protein  65.38 
 
 
74 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  56.36 
 
 
212 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4676  DNA binding domain protein, excisionase family  56.25 
 
 
80 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  44.9 
 
 
192 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  49.02 
 
 
185 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  40.38 
 
 
279 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  44.44 
 
 
201 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  45.45 
 
 
203 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 
201 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  43.14 
 
 
206 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  43.14 
 
 
206 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  45.45 
 
 
203 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  42.22 
 
 
201 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  42.62 
 
 
219 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0733  response regulator receiver protein  48.98 
 
 
215 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  43.9 
 
 
209 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  41.94 
 
 
219 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  43.64 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  44.74 
 
 
195 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3366  DNA binding domain protein, excisionase family  34.69 
 
 
71 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  43.14 
 
 
216 aa  41.6  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1938  excisionase family DNA-binding response regulator  39.58 
 
 
190 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2771  hypothetical protein  41.67 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604646  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  38 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
197 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>