54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4676 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4676  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  55.36 
 
 
67 aa  67  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  56.36 
 
 
74 aa  66.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  62.5 
 
 
64 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  56.6 
 
 
68 aa  63.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  58.49 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  58.49 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0819  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  62.5 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  54.9 
 
 
75 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  60.42 
 
 
73 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  58.33 
 
 
72 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0161  DNA binding domain-containing protein  52.63 
 
 
69 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177228  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  60.42 
 
 
79 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  52.63 
 
 
69 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0931  DNA binding domain protein, excisionase family  60.42 
 
 
68 aa  60.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2349  DNA binding domain protein, excisionase family  54.17 
 
 
79 aa  60.1  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3086  DNA binding domain protein, excisionase family  52.63 
 
 
69 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  46.43 
 
 
71 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0294  DNA binding domain protein, excisionase family  58.33 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03000  DNA-binding protein, excisionase family  58.33 
 
 
69 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0099  excisionase/Xis, DNA-binding  58.33 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2159  DNA binding domain protein, excisionase family  49.25 
 
 
72 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7205  DNA binding domain-containing protein  58.33 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0300475  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2751  excisionase/Xis, DNA-binding  56.25 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0704152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4391  DNA binding domain protein, excisionase family  56.25 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3348  excisionase family DNA binding domain-containing protein  56.25 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.401166 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0693  DNA binding domain protein, excisionase family  45.07 
 
 
79 aa  57.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0633565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8997  hypothetical protein  56.25 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34060  DNA-binding protein, excisionase family  54.17 
 
 
76 aa  57.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.910239  normal  0.267084 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2068  DNA binding domain-containing protein  56.25 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0301  DNA binding domain protein, excisionase family  56.25 
 
 
67 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4385  DNA binding domain-containing protein  46.43 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  42.22 
 
 
203 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  42.22 
 
 
203 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08990  DNA-binding protein, excisionase family  44.44 
 
 
72 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269526  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1042  DNA binding domain protein, excisionase family  48.98 
 
 
82 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  47.92 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1644  regulatory protein MerR  58.97 
 
 
41 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356829  normal 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9401  hypothetical protein  48.08 
 
 
74 aa  48.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  46.94 
 
 
219 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  43.75 
 
 
192 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  44 
 
 
219 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  47.92 
 
 
212 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  46.15 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3543  DNA binding domain-containing protein  41.82 
 
 
207 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000932058  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  38.64 
 
 
201 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  36.36 
 
 
201 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3366  DNA binding domain protein, excisionase family  43.59 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  38 
 
 
216 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0517  DNA binding domain protein, excisionase family  40.82 
 
 
207 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 
279 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  36.36 
 
 
201 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2025  DNA binding domain-containing protein  34.62 
 
 
206 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  41.3 
 
 
70 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.687205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>