41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1504 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 77 aa  156  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3366  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 71 aa  75.5  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0819  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  46.3 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  43.86 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  43.86 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  46.15 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  44.64 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  44.23 
 
 		 192 aa  50.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  46.15 
 
 		 73 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  44.44 
 
 		 79 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0931  DNA binding domain protein, excisionase family  43.64 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0693  DNA binding domain protein, excisionase family  39.58 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0633565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  46.67 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1042  DNA binding domain protein, excisionase family  42.55 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 		 203 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 		 203 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  42.11 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03000  DNA-binding protein, excisionase family  40.98 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9401  hypothetical protein  41.07 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4676  DNA binding domain protein, excisionase family  46.15 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0517  DNA binding domain protein, excisionase family  45.83 
 
 		 207 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  44.68 
 
 		 201 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  33.82 
 
 		 212 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 		 185 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  42.86 
 
 		 279 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08990  DNA-binding protein, excisionase family  36.17 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269526  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0161  DNA binding domain-containing protein  37.25 
 
 		 69 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  40.91 
 
 		 197 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  37.25 
 
 		 69 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0733  response regulator receiver protein  47.92 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8997  hypothetical protein  38 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.944138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  40.91 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2751  excisionase/Xis, DNA-binding  38.78 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0704152  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3348  excisionase family DNA binding domain-containing protein  38 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.401166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4391  DNA binding domain protein, excisionase family  38 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  40 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34060  DNA-binding protein, excisionase family  32.26 
 
 		 76 aa  40  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.910239  normal  0.267084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0294  DNA binding domain protein, excisionase family  38 
 
 		 67 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>