64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0931 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0931  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
68 aa  135  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03000  DNA-binding protein, excisionase family  79.37 
 
 
69 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  85.96 
 
 
72 aa  101  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  85.19 
 
 
88 aa  97.1  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  85.19 
 
 
90 aa  96.7  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0819  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  88.24 
 
 
65 aa  95.5  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  81.03 
 
 
67 aa  95.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  88.24 
 
 
73 aa  94.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  79.03 
 
 
79 aa  94.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  88.24 
 
 
68 aa  94.4  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  88 
 
 
74 aa  92.8  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  86.27 
 
 
64 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0693  DNA binding domain protein, excisionase family  69.64 
 
 
79 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0633565  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34060  DNA-binding protein, excisionase family  72.73 
 
 
76 aa  84.3  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.910239  normal  0.267084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  67.21 
 
 
75 aa  84  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4391  DNA binding domain protein, excisionase family  75.47 
 
 
67 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3348  excisionase family DNA binding domain-containing protein  75.47 
 
 
67 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.401166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8997  hypothetical protein  75.47 
 
 
67 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0294  DNA binding domain protein, excisionase family  75.47 
 
 
67 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2751  excisionase/Xis, DNA-binding  75.47 
 
 
67 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0704152  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  67.74 
 
 
71 aa  82  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2068  DNA binding domain-containing protein  69.64 
 
 
69 aa  82  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  78 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0161  DNA binding domain-containing protein  78 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177228  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7205  DNA binding domain-containing protein  78 
 
 
68 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0300475  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0099  excisionase/Xis, DNA-binding  78 
 
 
68 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0301  DNA binding domain protein, excisionase family  78 
 
 
67 aa  80.5  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3086  DNA binding domain protein, excisionase family  74.51 
 
 
69 aa  80.5  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1042  DNA binding domain protein, excisionase family  68.63 
 
 
82 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2349  DNA binding domain protein, excisionase family  69.23 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4385  DNA binding domain-containing protein  67.86 
 
 
83 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2159  DNA binding domain protein, excisionase family  72.92 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08990  DNA-binding protein, excisionase family  68 
 
 
72 aa  72.8  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269526  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9401  hypothetical protein  60 
 
 
74 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  54.9 
 
 
212 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4676  DNA binding domain protein, excisionase family  60.42 
 
 
80 aa  60.8  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  44.64 
 
 
192 aa  57  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  50 
 
 
185 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1644  regulatory protein MerR  58.54 
 
 
41 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356829  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  41.07 
 
 
279 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  45.83 
 
 
203 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  43.64 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  45.83 
 
 
203 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  46.15 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3366  DNA binding domain protein, excisionase family  34.55 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  44.23 
 
 
216 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  46.55 
 
 
219 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  46.55 
 
 
219 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  37.04 
 
 
206 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  37.04 
 
 
206 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  42.22 
 
 
201 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  45.45 
 
 
201 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0733  response regulator receiver protein  51.06 
 
 
215 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  41.27 
 
 
201 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1537  response regulator receiver protein  34.38 
 
 
272 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2771  hypothetical protein  39.58 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604646  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5448  hypothetical protein  37.5 
 
 
71 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.289379  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1649  hypothetical protein  35.71 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0606557  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  36.51 
 
 
215 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  36.51 
 
 
215 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  41.38 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1938  excisionase family DNA-binding response regulator  37.74 
 
 
190 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1872  hypothetical protein  37.5 
 
 
75 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  31.67 
 
 
197 aa  40  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>