44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9401 on replicon NC_013596
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013596  Sros_9401  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  146  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0693  DNA binding domain protein, excisionase family  54.24 
 
 
79 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0633565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  56.72 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  58.18 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  53.97 
 
 
68 aa  63.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0819  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  59.26 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  56.67 
 
 
90 aa  63.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  60.78 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4391  DNA binding domain protein, excisionase family  65.38 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3348  excisionase family DNA binding domain-containing protein  65.38 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.401166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  62.75 
 
 
73 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8997  hypothetical protein  65.38 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  61.82 
 
 
79 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3086  DNA binding domain protein, excisionase family  57.63 
 
 
69 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0931  DNA binding domain protein, excisionase family  60 
 
 
68 aa  62  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03000  DNA-binding protein, excisionase family  61.54 
 
 
69 aa  62  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2751  excisionase/Xis, DNA-binding  65.38 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0704152  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2068  DNA binding domain-containing protein  63.46 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0161  DNA binding domain-containing protein  64.71 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177228  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  64.71 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  55 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  50.68 
 
 
72 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34060  DNA-binding protein, excisionase family  57.41 
 
 
76 aa  61.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.910239  normal  0.267084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0294  DNA binding domain protein, excisionase family  63.46 
 
 
67 aa  60.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  58.82 
 
 
74 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  58.82 
 
 
71 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4385  DNA binding domain-containing protein  57.14 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0099  excisionase/Xis, DNA-binding  62.75 
 
 
68 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7205  DNA binding domain-containing protein  62.75 
 
 
68 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0300475  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0301  DNA binding domain protein, excisionase family  62.75 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1042  DNA binding domain protein, excisionase family  51.85 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2349  DNA binding domain protein, excisionase family  53.85 
 
 
79 aa  57  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2159  DNA binding domain protein, excisionase family  54.55 
 
 
72 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08990  DNA-binding protein, excisionase family  53.57 
 
 
72 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  46.15 
 
 
212 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4676  DNA binding domain protein, excisionase family  48.08 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  41.07 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  38 
 
 
197 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  40 
 
 
192 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  37.74 
 
 
279 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  36 
 
 
202 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2705  DNA binding domain protein, excisionase family  39.66 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1537  response regulator receiver protein  39.29 
 
 
272 aa  40.4  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  41.51 
 
 
216 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>