59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08990 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_08990  DNA-binding protein, excisionase family  100 
 
 
72 aa  149  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269526  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  69.49 
 
 
75 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3348  excisionase family DNA binding domain-containing protein  73.68 
 
 
67 aa  84.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.401166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0301  DNA binding domain protein, excisionase family  73.68 
 
 
67 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8997  hypothetical protein  73.68 
 
 
67 aa  84.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0294  DNA binding domain protein, excisionase family  73.68 
 
 
67 aa  84  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7205  DNA binding domain-containing protein  77.36 
 
 
68 aa  84.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0300475  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0099  excisionase/Xis, DNA-binding  77.36 
 
 
68 aa  84.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34060  DNA-binding protein, excisionase family  70.91 
 
 
76 aa  83.6  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.910239  normal  0.267084 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4391  DNA binding domain protein, excisionase family  76.92 
 
 
67 aa  82.8  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2349  DNA binding domain protein, excisionase family  67.24 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2751  excisionase/Xis, DNA-binding  76.92 
 
 
67 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0704152  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2068  DNA binding domain-containing protein  76.92 
 
 
69 aa  82.8  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0161  DNA binding domain-containing protein  77.55 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177228  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  77.55 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3086  DNA binding domain protein, excisionase family  71.7 
 
 
69 aa  80.5  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  72.92 
 
 
71 aa  79.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4385  DNA binding domain-containing protein  67.92 
 
 
83 aa  76.6  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2159  DNA binding domain protein, excisionase family  72.92 
 
 
72 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  56.06 
 
 
73 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  60 
 
 
79 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0931  DNA binding domain protein, excisionase family  68 
 
 
68 aa  72.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  67.35 
 
 
68 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03000  DNA-binding protein, excisionase family  61.11 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  63.46 
 
 
74 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0693  DNA binding domain protein, excisionase family  48.57 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0633565  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  62.96 
 
 
64 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  66.67 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0819  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  58.62 
 
 
65 aa  70.5  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  59.26 
 
 
72 aa  70.1  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  64.58 
 
 
67 aa  70.1  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  66.67 
 
 
88 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1042  DNA binding domain protein, excisionase family  59.57 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  44.26 
 
 
192 aa  64.3  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  55.1 
 
 
212 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9401  hypothetical protein  53.57 
 
 
74 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  48.98 
 
 
185 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4676  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 
80 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1644  regulatory protein MerR  64.1 
 
 
41 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356829  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 
203 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 
203 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  44.68 
 
 
201 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  40.38 
 
 
201 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  44.9 
 
 
279 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  38.89 
 
 
201 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  47.37 
 
 
195 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  42.86 
 
 
206 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  42.86 
 
 
206 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2025  DNA binding domain-containing protein  35.71 
 
 
206 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1938  excisionase family DNA-binding response regulator  44.19 
 
 
190 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3543  DNA binding domain-containing protein  38.18 
 
 
207 aa  43.5  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000932058  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1745  DNA binding domain-containing protein  37.74 
 
 
205 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  36.17 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1649  hypothetical protein  38.78 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0606557  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1872  hypothetical protein  38.78 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2583  hypothetical protein  38.78 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.011334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2771  hypothetical protein  38.78 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604646  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3366  DNA binding domain protein, excisionase family  36.36 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  36.21 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>