29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2025 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2025  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 206 aa  420  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1745  DNA binding domain-containing protein  85.85 
 
 		 205 aa  358  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3543  DNA binding domain-containing protein  54.46 
 
 		 207 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000932058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0517  DNA binding domain protein, excisionase family  36.76 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  51.06 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  53.33 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  54.55 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  44.07 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  44.07 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  42.59 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  36.21 
 
 		 279 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  45.45 
 
 		 94 aa  49.3  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  36 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  36 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  42.62 
 
 		 295 aa  48.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  35 
 
 		 219 aa  44.7  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  48.78 
 
 		 136 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  54.05 
 
 		 127 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08990  DNA-binding protein, excisionase family  35.71 
 
 		 72 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269526  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0733  response regulator receiver protein  30 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  36 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8653  DNA binding domain protein, excisionase family  55.88 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  39.58 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  32.88 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08390  predicted transcriptional regulator  44.64 
 
 		 121 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2305  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 		 107 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2544  DNA binding domain-containing protein  55.88 
 
 		 141 aa  41.6  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  37.1 
 
 		 197 aa  41.2  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  34.55 
 
 		 75 aa  41.2  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.553184 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>