165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1219 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
201 aa  407  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  67.68 
 
 
203 aa  292  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  67.68 
 
 
203 aa  292  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  64.68 
 
 
201 aa  279  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  56.22 
 
 
201 aa  225  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  50 
 
 
215 aa  198  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  50 
 
 
215 aa  198  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  48.73 
 
 
219 aa  186  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  44.72 
 
 
205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  44.22 
 
 
205 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  49.16 
 
 
209 aa  178  4e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  45.74 
 
 
197 aa  176  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  37.13 
 
 
229 aa  136  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  36.63 
 
 
229 aa  135  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  35.64 
 
 
229 aa  132  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  45.89 
 
 
148 aa  128  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  34.55 
 
 
195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  35.15 
 
 
222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  33.85 
 
 
195 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  34.55 
 
 
207 aa  123  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
197 aa  118  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  32.14 
 
 
201 aa  118  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  35 
 
 
209 aa  117  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  35.71 
 
 
215 aa  116  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  32.8 
 
 
202 aa  115  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 
213 aa  115  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 
213 aa  115  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  33.83 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  35.15 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  34.18 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  35.15 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  34.18 
 
 
244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  35.71 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  33.83 
 
 
216 aa  111  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 
216 aa  111  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  33.17 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  33.17 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  33.84 
 
 
194 aa  108  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  33.84 
 
 
192 aa  108  6e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  31.71 
 
 
208 aa  107  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  31.71 
 
 
208 aa  106  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 
193 aa  105  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  32.83 
 
 
192 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  28.02 
 
 
208 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  30.05 
 
 
195 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  32.32 
 
 
192 aa  101  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  32.98 
 
 
209 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  33.33 
 
 
222 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  32.46 
 
 
222 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  32.8 
 
 
222 aa  98.6  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  32.32 
 
 
195 aa  98.6  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  32.26 
 
 
193 aa  97.1  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  34.92 
 
 
207 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  29.44 
 
 
206 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  29.44 
 
 
206 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  31.86 
 
 
191 aa  89.4  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  30.21 
 
 
212 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  34.59 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  27.68 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  30 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  28.18 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  30.94 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  54.55 
 
 
74 aa  76.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  27.75 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  28.42 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  28.42 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  31.15 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  27.27 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  56.45 
 
 
74 aa  73.6  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  28.18 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  26.26 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  27.22 
 
 
182 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  27.61 
 
 
203 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  24.88 
 
 
196 aa  57.4  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2025  DNA binding domain-containing protein  54.55 
 
 
206 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  30.69 
 
 
116 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1745  DNA binding domain-containing protein  45.1 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  36.59 
 
 
94 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  36.71 
 
 
128 aa  52  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  45.1 
 
 
295 aa  51.6  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  39.29 
 
 
192 aa  51.6  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  50 
 
 
707 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  23.48 
 
 
162 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0517  DNA binding domain protein, excisionase family  46.67 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  42.59 
 
 
185 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  47.73 
 
 
279 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34060  DNA-binding protein, excisionase family  41.82 
 
 
76 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.910239  normal  0.267084 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1938  excisionase family DNA-binding response regulator  46.51 
 
 
190 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2159  DNA binding domain protein, excisionase family  52.27 
 
 
72 aa  49.3  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  52.17 
 
 
319 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08990  DNA-binding protein, excisionase family  44.68 
 
 
72 aa  48.5  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269526  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  45.45 
 
 
75 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  45.45 
 
 
71 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2349  DNA binding domain protein, excisionase family  43.18 
 
 
79 aa  46.6  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0161  DNA binding domain-containing protein  44.44 
 
 
69 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177228  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3086  DNA binding domain protein, excisionase family  43.4 
 
 
69 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  44.44 
 
 
69 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0733  response regulator receiver protein  44.68 
 
 
215 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2068  DNA binding domain-containing protein  44.44 
 
 
69 aa  46.2  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3543  DNA binding domain-containing protein  47.37 
 
 
207 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000932058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>