26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0517 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0517  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 207 aa  410  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1745  DNA binding domain-containing protein  35.85 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2025  DNA binding domain-containing protein  35.78 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3543  DNA binding domain-containing protein  33.96 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000932058  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  47.17 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  41.27 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  54.55 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  48.89 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  51.22 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  46.67 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1938  excisionase family DNA-binding response regulator  37.29 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  41.3 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  45.83 
 
 		 77 aa  45.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  42.31 
 
 		 295 aa  45.1  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  46.15 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2479  putative GAF sensor protein  37.7 
 
 		 363 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.376583 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3695  DNA binding domain-containing protein  42.59 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1042  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 82 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  48.89 
 
 		 136 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3714  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3574  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  38 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3640  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 207 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.196846  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0562  excisionase/Xis, DNA-binding  43.4 
 
 		 195 aa  41.6  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>