165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3640 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3640  response regulator receiver protein  100 
 
 
207 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.196846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3714  response regulator receiver protein  98.55 
 
 
207 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3574  response regulator receiver domain-containing protein  94.76 
 
 
207 aa  300  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3695  DNA binding domain-containing protein  73.6 
 
 
210 aa  259  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03493  response regulator  27.47 
 
 
186 aa  77.8  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0855  DNA-binding response regulator  29.71 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0365807  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2544  DNA binding domain protein, excisionase family  31.25 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0361834  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2854  DNA binding domain protein, excisionase family  36.67 
 
 
190 aa  72  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1537  response regulator receiver protein  25 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2540  response regulator  23.78 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4196  response regulator receiver domain-containing protein  28.08 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5042  excisionase/Xis, DNA-binding  28.42 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2239  response regulator receiver protein  25.89 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  hitchhiker  0.0000034786 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0562  excisionase/Xis, DNA-binding  28.07 
 
 
195 aa  55.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  23.91 
 
 
185 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0451  response regulator receiver protein  28.08 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1938  excisionase family DNA-binding response regulator  25 
 
 
190 aa  52.4  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  30.32 
 
 
1257 aa  52  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
348 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  40.58 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3131  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.75 
 
 
464 aa  49.3  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0733  response regulator receiver protein  54.72 
 
 
215 aa  49.7  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  37.08 
 
 
219 aa  48.9  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3146  histidine kinase  33.33 
 
 
1140 aa  48.5  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.353593  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  36.36 
 
 
127 aa  48.5  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3108  response regulator receiver protein  31.9 
 
 
122 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6062  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  29.52 
 
 
144 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0925  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.17 
 
 
500 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5456  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.5 
 
 
251 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.228477  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  28.57 
 
 
127 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.51 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  30.77 
 
 
123 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  27.35 
 
 
247 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  27.5 
 
 
123 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
991 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  28.57 
 
 
126 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2479  putative GAF sensor protein  34.75 
 
 
363 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.376583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
970 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  33.33 
 
 
123 aa  45.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.05 
 
 
350 aa  45.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 
917 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.07 
 
 
273 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  27.62 
 
 
123 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  51.11 
 
 
295 aa  46.2  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  30.58 
 
 
121 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  30.83 
 
 
232 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  32.69 
 
 
123 aa  45.4  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
756 aa  45.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  27.62 
 
 
126 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  32.69 
 
 
123 aa  45.1  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.59 
 
 
235 aa  45.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  35 
 
 
235 aa  45.1  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  31.09 
 
 
230 aa  45.1  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  49.02 
 
 
133 aa  45.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  41.18 
 
 
216 aa  44.7  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  26.39 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 
237 aa  44.3  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1802  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.65 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  28.07 
 
 
121 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  55.1 
 
 
136 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7254  response regulator receiver protein  33.59 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.122444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  48.84 
 
 
137 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1221  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 
256 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.655279  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  25.71 
 
 
123 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  27.73 
 
 
351 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0905  response regulator receiver protein  26.19 
 
 
394 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
679 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  31.01 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  34.95 
 
 
304 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0930  response regulator receiver protein  41.38 
 
 
456 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139996  normal  0.100238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  31.01 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  29.63 
 
 
122 aa  44.3  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  31.01 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3098  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.97 
 
 
491 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  31.01 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  31.45 
 
 
229 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  31.45 
 
 
229 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.26 
 
 
243 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  28.95 
 
 
121 aa  43.5  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  31.45 
 
 
229 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  33.02 
 
 
121 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
121 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  28.95 
 
 
121 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  27.64 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  26.92 
 
 
125 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.41 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.05 
 
 
354 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  34.45 
 
 
128 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  26.67 
 
 
123 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.29 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  26.42 
 
 
126 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  28.57 
 
 
124 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  43.28 
 
 
246 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 
1303 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  26.42 
 
 
126 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
121 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  38.81 
 
 
230 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  38.81 
 
 
230 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  27.34 
 
 
229 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0897949 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>