More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03493 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03493  response regulator  100 
 
 		 186 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1537  response regulator receiver protein  57.07 
 
 		 272 aa  220  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2540  response regulator  45.83 
 
 		 192 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2544  DNA binding domain protein, excisionase family  31.44 
 
 		 264 aa  98.6  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0361834  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0855  DNA-binding response regulator  30.27 
 
 		 189 aa  95.1  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0365807  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2854  DNA binding domain protein, excisionase family  29.31 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 1609 aa  81.6  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  35 
 
 		 1888 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2427  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.65 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 1974 aa  75.5  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  33.06 
 
 		 1956 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0252  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 306 aa  75.1  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 125 aa  73.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1195 aa  73.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  33.06 
 
 		 1989 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 2423 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2044  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0300859  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 1725 aa  72.4  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 1725 aa  72.4  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  34.88 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  32.5 
 
 		 2026 aa  71.6  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 2026 aa  72  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5042  excisionase/Xis, DNA-binding  29.26 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2029  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371136 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 1907 aa  71.2  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 377 aa  71.2  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  36.94 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2054  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880044 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1938  excisionase family DNA-binding response regulator  26.32 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 2539 aa  70.5  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  32.5 
 
 		 2301 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1832  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.372268  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  27.19 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1806  alkaline phosphatase synthesis response regulator  33.33 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000153503  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2010  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.93984e-43 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  31.62 
 
 		 1983 aa  69.7  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1975  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0483655  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.71 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  32.17 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1789  alkaline phosphatase synthesis response regulator  33.33 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11323  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  32.23 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 1758 aa  69.3  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 531 aa  69.3  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  28.89 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 2212 aa  69.3  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  29.1 
 
 		 1834 aa  69.7  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  29.57 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  29.63 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  26.72 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  31.45 
 
 		 297 aa  68.6  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2059  DNA-binding response regulator  32.48 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000985599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 974 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.82 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.77 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 2009 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0513  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.76 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  32.5 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 251 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3442  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.86 
 
 		 539 aa  68.2  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.677434  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  32.48 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 2012 aa  67.8  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 1832 aa  67.8  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  32.77 
 
 		 2070 aa  67.8  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 1954 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1718  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 224 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0955826  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.91 
 
 		 221 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.75 
 
 		 234 aa  67.8  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 246 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  31.58 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  31.58 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  32.23 
 
 		 1970 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 236 aa  67  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 2137 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 1646 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 1646 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  32.48 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  33.33 
 
 		 705 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  31.67 
 
 		 2301 aa  66.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  30.51 
 
 		 2458 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04920  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.62 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  31.3 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0237  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000555979 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  33.06 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2406  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 1647 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 131 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 1964 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2199  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  32.76 
 
 		 344 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.425276 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  35.24 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  30.51 
 
 		 2476 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.5 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.38 
 
 		 1992 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>