More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0855 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0855  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0365807  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2544  DNA binding domain protein, excisionase family  34.07 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0361834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2540  response regulator  31.91 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1938  excisionase family DNA-binding response regulator  29.05 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03493  response regulator  30.27 
 
 		 186 aa  95.1  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1537  response regulator receiver protein  33.15 
 
 		 272 aa  93.6  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  28.04 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  24.87 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3695  DNA binding domain-containing protein  30.34 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3134  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 500 aa  71.2  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.17 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  31.5 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0437  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5042  excisionase/Xis, DNA-binding  24.86 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 969 aa  68.2  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1032  response regulator  35.65 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0894814  normal  0.523068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.84 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.9 
 
 		 392 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 503 aa  65.5  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2239  response regulator receiver protein  25.15 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  hitchhiker  0.0000034786 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  30.83 
 
 		 971 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.51 
 
 		 711 aa  64.7  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7417  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.87 
 
 		 457 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  30.4 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.38 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05331  transcriptional regulatory protein CpxR  35.59 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1392  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.11 
 
 		 584 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2854  DNA binding domain protein, excisionase family  22.22 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  36.56 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  34.43 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.13 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 1974 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  33.61 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6157  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0448783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5611  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.48 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.736991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6679  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.78 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000557  DNA-binding response regulator  34.19 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.702579  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  27.97 
 
 		 2458 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  27.97 
 
 		 2476 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0289  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.43 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000126796  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0907  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.61 
 
 		 457 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401363  normal  0.40647 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0290  response regulator receiver domain-containing protein  31.67 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870097  hitchhiker  0.0000582863 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  24.79 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1391  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 128 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1672  DNA-binding response regulator  31.45 
 
 		 247 aa  62  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0967  diguanylate cyclase  32.61 
 
 		 457 aa  62  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0207283 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7054  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 236 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 265 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  29.13 
 
 		 263 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0931  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.61 
 
 		 457 aa  62  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.104843 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 322 aa  62  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106122 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 265 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  29.13 
 
 		 263 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  29.13 
 
 		 263 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1280  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121052  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6551  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  30.83 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0859  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 		 338 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0871  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 		 338 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 		 338 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  25.83 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 423 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0836  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 		 338 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 423 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1193  two component transcriptional regulator  32.2 
 
 		 232 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0519929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  30.97 
 
 		 251 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0938  DNA-binding response regulator  31.9 
 
 		 234 aa  61.2  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000299191  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4235  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 232 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  28.7 
 
 		 381 aa  61.2  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0562  excisionase/Xis, DNA-binding  27.78 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  29.17 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 381 aa  61.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 2423 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  28.57 
 
 		 1374 aa  60.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  32.79 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.93 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3774  response regulator receiver protein  32.63 
 
 		 123 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3065  DNA-binding response regulator  35.58 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00140102  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 991 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0451  response regulator receiver protein  24.14 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3723  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  35.44 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0976167  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  30.95 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  30.63 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2093  two component transcriptional regulator  27.27 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.582679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.73 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  27.93 
 
 		 1152 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0467  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 124 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117091  normal  0.827791 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  26.72 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>