More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2239 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2239  response regulator receiver protein  100 
 
 		 209 aa  420  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  hitchhiker  0.0000034786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1874  response regulator receiver protein  65.48 
 
 		 212 aa  244  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5042  excisionase/Xis, DNA-binding  36.13 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0562  excisionase/Xis, DNA-binding  33.33 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4196  response regulator receiver domain-containing protein  34.3 
 
 		 215 aa  98.2  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0451  response regulator receiver protein  30.59 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2708  response regulator receiver protein  29.61 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.18523  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2544  DNA binding domain protein, excisionase family  27.37 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0361834  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0733  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1938  excisionase family DNA-binding response regulator  23.84 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1684  GGDEF domain-containing protein  32.71 
 
 		 323 aa  72  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0839  DNA binding domain-containing protein  28.03 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  22.58 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 904 aa  66.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0855  DNA-binding response regulator  25.15 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0365807  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2670  excisionase/Xis, DNA-binding  48.53 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.59 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0587  excisionase/Xis, DNA-binding  52.73 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 		 1022 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2479  putative GAF sensor protein  30.3 
 
 		 363 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.376583 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2264  response regulator receiver  31 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6015  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  23.6 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  25.94 
 
 		 1335 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 		 1426 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  26.02 
 
 		 1374 aa  58.9  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2812  diguanylate cyclase  30.84 
 
 		 315 aa  58.5  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0828  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.48 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  30.51 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4132  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.1 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  27.87 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1636  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.71 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2257  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0520127 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3199  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.97 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3384  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.38 
 
 		 829 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4204  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.1 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.23 
 
 		 945 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03429  two-component system response regulator (hybrid family) protein  32.97 
 
 		 358 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  32.11 
 
 		 275 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  34.12 
 
 		 1834 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 		 1362 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4336  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.17 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3123  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.78 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0046  chemotaxis-specific methylesterase  33.94 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000324346  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 		 1003 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1713  two component LuxR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 361 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  31.78 
 
 		 1427 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  36.27 
 
 		 1361 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0876  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.75 
 
 		 709 aa  55.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0730078  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  30.33 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 		 991 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2746  response regulator receiver protein  29.76 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459198 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 707 aa  55.5  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  26.23 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 553 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  30.97 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1561  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.44 
 
 		 455 aa  55.1  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 984 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.17 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.47 
 
 		 1960 aa  55.1  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0778  response regulator receiver domain-containing protein  32.61 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.17 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  25.81 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.1 
 
 		 305 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  29.76 
 
 		 998 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  28.33 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 414 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2689  response regulator/sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 365 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 		 858 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0871  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 338 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0216  sensor histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 364 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3695  DNA binding domain-containing protein  26.28 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  28.33 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.5 
 
 		 935 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4702  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 381 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0969  sensor histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 364 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  31.97 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  26.72 
 
 		 122 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 977 aa  54.3  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1396  response regulator/sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 365 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1282  response regulator receiver domain-containing protein  29.47 
 
 		 164 aa  54.3  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.546653  hitchhiker  0.0000171742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  32.63 
 
 		 1414 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 338 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1593  response regulator/sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 364 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  31.97 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2544  response regulator/sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 365 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0981  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 155 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0252  response regulator/sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 365 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549911  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0836  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 338 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  31.97 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  31.97 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  31.97 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>