210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3574 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3574  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
207 aa  394  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3714  response regulator receiver protein  92.27 
 
 
207 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3640  response regulator receiver protein  94.76 
 
 
207 aa  314  6e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.196846  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3695  DNA binding domain-containing protein  73.6 
 
 
210 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03493  response regulator  29.12 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2544  DNA binding domain protein, excisionase family  32.39 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0361834  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2854  DNA binding domain protein, excisionase family  31.91 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0855  DNA-binding response regulator  29.53 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0365807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1537  response regulator receiver protein  26.09 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2540  response regulator  24.86 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4196  response regulator receiver domain-containing protein  28.77 
 
 
215 aa  62  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2239  response regulator receiver protein  27.6 
 
 
209 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  hitchhiker  0.0000034786 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0562  excisionase/Xis, DNA-binding  28.99 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5042  excisionase/Xis, DNA-binding  30.34 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0451  response regulator receiver protein  28.77 
 
 
213 aa  54.7  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  24.18 
 
 
185 aa  52.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1938  excisionase family DNA-binding response regulator  25.42 
 
 
190 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  32.48 
 
 
123 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  29.06 
 
 
247 aa  51.6  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
144 aa  51.6  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  35.58 
 
 
123 aa  50.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  30.82 
 
 
1257 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
348 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3131  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35 
 
 
464 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  36.54 
 
 
128 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  35.85 
 
 
121 aa  49.7  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  31.43 
 
 
127 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  40.58 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0733  response regulator receiver protein  54.72 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  30.51 
 
 
126 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  30 
 
 
123 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  33.65 
 
 
123 aa  48.9  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5456  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.71 
 
 
251 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.228477  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  40.58 
 
 
219 aa  48.9  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
679 aa  48.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 
231 aa  48.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  30.48 
 
 
123 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  33.33 
 
 
123 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  33.88 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.93 
 
 
354 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
991 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  35 
 
 
235 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  29.66 
 
 
126 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3871  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.23 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473157  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  32.23 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  28.36 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3146  histidine kinase  31.75 
 
 
1140 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.353593  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  31.54 
 
 
256 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  29.03 
 
 
247 aa  46.6  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2479  putative GAF sensor protein  32.51 
 
 
363 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.376583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  28.36 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  30.58 
 
 
121 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  28.36 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  30.7 
 
 
121 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  28.36 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.07 
 
 
273 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  27.08 
 
 
192 aa  46.2  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  28.36 
 
 
229 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  28.36 
 
 
229 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  30.25 
 
 
124 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  31.58 
 
 
121 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 
229 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  26.27 
 
 
123 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 
231 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  31.5 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  29.84 
 
 
257 aa  45.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  27.61 
 
 
229 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  27.61 
 
 
229 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3098  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.17 
 
 
491 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  34.55 
 
 
304 aa  45.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  27.61 
 
 
229 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  51.11 
 
 
295 aa  45.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 
230 aa  45.4  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  32.38 
 
 
123 aa  45.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  27.61 
 
 
229 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.46 
 
 
1960 aa  45.4  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  31.58 
 
 
121 aa  45.4  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  29.03 
 
 
247 aa  45.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.23 
 
 
263 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  30.83 
 
 
232 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  41.18 
 
 
216 aa  45.4  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  29.25 
 
 
126 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  29.25 
 
 
126 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3108  response regulator receiver protein  33.61 
 
 
122 aa  45.1  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6062  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  31.4 
 
 
228 aa  45.1  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  30.7 
 
 
121 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.8 
 
 
246 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.8 
 
 
246 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
553 aa  45.1  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0925  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.31 
 
 
500 aa  45.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.62 
 
 
1131 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  29.51 
 
 
121 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0840  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
132 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  48.84 
 
 
137 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  31.5 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 
1303 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2708  response regulator receiver protein  27.92 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.18523  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  27.21 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.4 
 
 
242 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.74 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>